More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2280 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
202 aa  380  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  82.98 
 
 
202 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  82.98 
 
 
202 aa  269  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  52.8 
 
 
215 aa  194  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  54.27 
 
 
197 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  43.19 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  40.91 
 
 
231 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  36.74 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  45.24 
 
 
230 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2840  peptidase M22  66.39 
 
 
218 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000908418  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
231 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  37.33 
 
 
261 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  44.44 
 
 
232 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.33 
 
 
261 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  44.44 
 
 
233 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  38.46 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  36.16 
 
 
229 aa  95.9  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  47.58 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  37.62 
 
 
220 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  44.35 
 
 
233 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  41.61 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  43.8 
 
 
230 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  42.15 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  40.19 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  44.93 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  44.2 
 
 
224 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  45.45 
 
 
230 aa  91.7  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  41.27 
 
 
236 aa  91.3  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  45.16 
 
 
228 aa  91.3  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  44.2 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  35.68 
 
 
220 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  35.06 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  33.79 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  45.9 
 
 
224 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  34.72 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.55 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  36.14 
 
 
210 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  41.67 
 
 
228 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  38.07 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  42.06 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  38.02 
 
 
241 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  30.53 
 
 
235 aa  85.1  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  38.28 
 
 
218 aa  85.1  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  35.27 
 
 
228 aa  85.1  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  44.72 
 
 
224 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  42.98 
 
 
223 aa  85.1  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  43.9 
 
 
224 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  43.61 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  47.62 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  41.13 
 
 
237 aa  84  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  34.95 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  43.44 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  42.19 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  34.95 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  38.33 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  43.94 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  43.09 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  39.68 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  38.64 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  44.35 
 
 
231 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  34.47 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  38.64 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  38.64 
 
 
232 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  31.96 
 
 
233 aa  82  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  39.68 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  37.69 
 
 
240 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  40.65 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  43.8 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  39.68 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  34.48 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  43.8 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  39.68 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  45.08 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  41.46 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  35 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  37.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  34.71 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  48.08 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  37.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  37.5 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  34.25 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  39.84 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  36 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  35.78 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  37.5 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  38.41 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  37.5 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  36.74 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  41.73 
 
 
233 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  29.91 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  36.97 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>