More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2840 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2840  peptidase M22  100 
 
 		 218 aa  408  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000908418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  53.81 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  47.8 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  51.01 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  52.26 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  52.26 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  46.86 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  40.09 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  39.81 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  37.91 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  40.09 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  39.3 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  42.96 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  35.53 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  37.16 
 
 		 231 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  39.88 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  43.18 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  43.18 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.44 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  32.58 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  37.67 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.61 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  45.99 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  37.33 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  35.45 
 
 		 259 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  39.72 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  36.97 
 
 		 255 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  37.58 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  39.52 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  41.47 
 
 		 230 aa  88.2  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  41.54 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  35.65 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  34.53 
 
 		 238 aa  85.5  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  40.27 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  32.88 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  33.05 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  31.19 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  38.41 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  34.6 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  35.16 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  40.77 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  38.41 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  39.42 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0335  peptidase M22, glycoprotease  25.53 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.851961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  35.76 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  35.77 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  35.76 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  32.61 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  34.31 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  34.31 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  32.86 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  35.11 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  35.76 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3228  glycoprotease family protein  34.31 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  34.31 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  34.31 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  41.13 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  32.27 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  35.76 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2521  glycoprotease family protein  34.78 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2465  glycoprotease family protein  34.78 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  34.4 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  35.16 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.48 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.43 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.43 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  35.03 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  36.64 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.43 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  37.7 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  31.08 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  37.12 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  37.12 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  37.12 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.88 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  36.64 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  38.76 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  36.09 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  34.92 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  34.1 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  34.1 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0730  glycoprotease family protein  27.91 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  37.67 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  36.16 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  22.03 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  37.12 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  37.12 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0210  endopeptidase-related protein  30.43 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  37.3 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  34.85 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  35.71 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  37.06 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>