More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2069 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
208 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0987  peptidase M22, glycoprotease  49.75 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2382  peptidase M22, glycoprotease  53 
 
 
204 aa  144  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  36.71 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  36.57 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  45.71 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  45.71 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  50 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  33.02 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  46.67 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.51 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  46.67 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  46.67 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  33.18 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  31.39 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  41.54 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  45.63 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  48 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  48 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  45.63 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  41.9 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  46 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  47 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  47 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  46 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0335  peptidase M22, glycoprotease  28.36 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.851961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  47 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  45 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  46 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  45.36 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  35 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  32.05 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  46 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  32.05 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  47.42 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  46.39 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  33.48 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  44.33 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  46.39 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0730  glycoprotease family protein  25 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  49.48 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  47.42 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  33.9 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  34.08 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  33.48 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  40.95 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  35.48 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  42.45 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  44 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  41 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  43.56 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  33.04 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  48.08 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  42.48 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  33.04 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  40.22 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  37.5 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  38.83 
 
 
241 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  31.88 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  28.96 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  33.33 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  28.92 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  36.84 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  28.92 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  30.67 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  36.19 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  38.78 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  41.24 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  41.24 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  30.91 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  42 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  30.06 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.84 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  31.37 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  36.89 
 
 
237 aa  64.7  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  45.19 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  41.9 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  34.08 
 
 
259 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  39 
 
 
231 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  43 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  37.25 
 
 
238 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>