More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0023 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
220 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  90.91 
 
 
220 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  54.15 
 
 
229 aa  231  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  53.21 
 
 
218 aa  191  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  47.58 
 
 
261 aa  186  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  47.58 
 
 
261 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  44.49 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  43.48 
 
 
225 aa  155  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  41.92 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  43.12 
 
 
232 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  41.41 
 
 
227 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  41.63 
 
 
232 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  42.47 
 
 
231 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  42.79 
 
 
230 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  39.11 
 
 
226 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  38.67 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  38.36 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  41.26 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  38.53 
 
 
231 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
234 aa  124  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  34.03 
 
 
235 aa  121  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  39.47 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  36.89 
 
 
259 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  40.64 
 
 
231 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  36.87 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  37.73 
 
 
213 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.35 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  36.94 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  35.35 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  36.09 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  36.09 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  30.06 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  34.91 
 
 
239 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  36.09 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  36.09 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  36.09 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  34.85 
 
 
211 aa  92.8  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  34.34 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.75 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  33.12 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  34.38 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  36.94 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  36.09 
 
 
239 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  32.89 
 
 
233 aa  89  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  32.61 
 
 
228 aa  88.6  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  36.92 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  32.53 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  32.31 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  33.73 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  34.33 
 
 
239 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  34.59 
 
 
231 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  30.77 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  38.92 
 
 
238 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  34.13 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  34.13 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
236 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  32.31 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
236 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.31 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  35.88 
 
 
236 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  33.83 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.43 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  29.03 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_002978  WD0210  endopeptidase-related protein  36.17 
 
 
191 aa  85.5  6e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.52257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  33.77 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  34.09 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0335  peptidase M22, glycoprotease  28.67 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.851961  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  37.29 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4358  peptidase M22, glycoprotease  32.2 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  33.95 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4976  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  29.6 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  35.94 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0618  peptidase M22 glycoprotease  31.65 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.38 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 
212 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  35.38 
 
 
238 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  32.31 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0714  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  36.92 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  37.21 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  29.61 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  36 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  35.29 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  32.02 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>