More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0037 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
218 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  53.21 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  52.29 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  47.01 
 
 
229 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  45.78 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  45.78 
 
 
261 aa  178  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  43.56 
 
 
229 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  43.64 
 
 
231 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  44.29 
 
 
232 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  44.29 
 
 
227 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  45.33 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  41.1 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  42.79 
 
 
225 aa  138  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  38.81 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  46.82 
 
 
231 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  38.16 
 
 
234 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  42.67 
 
 
233 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  39.73 
 
 
259 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  37.12 
 
 
226 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  38.5 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  39.57 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  39.19 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  40.65 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  31.91 
 
 
235 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  37.96 
 
 
215 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  35.24 
 
 
232 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  36.32 
 
 
231 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.65 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.65 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.65 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.65 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.65 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.58 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  35.32 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  42.34 
 
 
250 aa  96.3  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  33.75 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  34.48 
 
 
231 aa  94  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  34.48 
 
 
231 aa  94  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.48 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  38.12 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  34.48 
 
 
231 aa  94  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.48 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  33.91 
 
 
231 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.48 
 
 
231 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.48 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  34.86 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  35.41 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.07 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  42.19 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.3 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  33.78 
 
 
231 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  34.51 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.06 
 
 
231 aa  91.7  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  32.14 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  34.86 
 
 
236 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  34.4 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  41.54 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  41.43 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  41.88 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  36.2 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  40.29 
 
 
228 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  38.46 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  32.06 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  32.06 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  32.06 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  34.93 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  36.88 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  33.85 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  38.69 
 
 
230 aa  88.6  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  35.32 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  34.7 
 
 
237 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  35.76 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  34.9 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  32.59 
 
 
224 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  37.27 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  33.79 
 
 
237 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  33.79 
 
 
237 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  44 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  32 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  37.68 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  34.25 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  35.43 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  33.94 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  31.28 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  39.26 
 
 
241 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  34.72 
 
 
239 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1401  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  33.09 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  40.16 
 
 
238 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  33.19 
 
 
248 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
232 aa  84.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
237 aa  84.7  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  32.44 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  37.5 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  41.79 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  40.15 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  36.57 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.74 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  32.44 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>