More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3092 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
215 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  58.59 
 
 
202 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  58.59 
 
 
202 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  52.76 
 
 
202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  49.77 
 
 
215 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  51.44 
 
 
197 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2840  peptidase M22  53.27 
 
 
218 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000908418  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  35.98 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  35.98 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  38.14 
 
 
229 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  44.53 
 
 
233 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  37.16 
 
 
232 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  45.31 
 
 
231 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  36.49 
 
 
235 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
232 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  36.7 
 
 
261 aa  101  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  36.7 
 
 
261 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  42.86 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  42.97 
 
 
230 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  36.07 
 
 
227 aa  98.6  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  35.78 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  41.94 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  35.78 
 
 
226 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  42.28 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.68 
 
 
231 aa  94.7  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  34.86 
 
 
226 aa  94  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  29.25 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  35.65 
 
 
227 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  33.62 
 
 
229 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  36.71 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  41.8 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  40.65 
 
 
231 aa  92  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  40.77 
 
 
233 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
236 aa  91.7  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  31.6 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  33.18 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  33.76 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  33.18 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  41.41 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  41.8 
 
 
233 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  40.31 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  35.35 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  43.55 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  37.96 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  40.62 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  40.98 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  41.41 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  40 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  30.52 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  32.7 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  32.42 
 
 
231 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  32.42 
 
 
231 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  37.98 
 
 
228 aa  88.6  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  36.17 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  37.7 
 
 
239 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  33.03 
 
 
232 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  32.59 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  39.84 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  40.48 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.96 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.96 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.96 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  33.92 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  32 
 
 
231 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  36.76 
 
 
238 aa  86.3  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  33.65 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  40.8 
 
 
237 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  34.08 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  35.57 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  47.58 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  39.84 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  29.55 
 
 
222 aa  85.1  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  40.83 
 
 
239 aa  84.7  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  42.97 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  32.58 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  38.33 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  39.34 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  39.34 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  40.98 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  33.81 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  35.82 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  37.9 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  33.76 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  37.4 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  40.16 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  39.2 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  39.02 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  37.82 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  39.34 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  38.24 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  37.1 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  39.52 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>