More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0432 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  54.15 
 
 		 220 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  54.59 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  43.42 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  43.42 
 
 		 261 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  47.01 
 
 		 218 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  44.64 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  42.04 
 
 		 231 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  41.78 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  42.22 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  41.63 
 
 		 230 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  40.99 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  41.74 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  39.57 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  39.58 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  35.71 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  36.96 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  37.82 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  37.33 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  37.39 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  38.05 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  39.58 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  39.29 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  36.96 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  35.93 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  37.83 
 
 		 213 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  41.86 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.35 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  38.06 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  41.09 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  38.06 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  38.06 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  41.94 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  38.06 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  38.06 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  34.2 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  34.63 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  37.59 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  33.62 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  36.84 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  35.11 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  42.74 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  43.55 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  42.74 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  30.94 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  30.94 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  30.94 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  37.88 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  42.74 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  36.77 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  40.48 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  35.94 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  41.13 
 
 		 224 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  37.18 
 
 		 230 aa  88.2  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.53 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  39.84 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  33.03 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  41.94 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.12 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  39.39 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  31.9 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  41.94 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  39.53 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  38.1 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2363  peptidase M22, glycoprotease  44.96 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  33.85 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  33.85 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  31.85 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  44.19 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  31.4 
 
 		 230 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  41.56 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  34.85 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  41.13 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  39.85 
 
 		 236 aa  84.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  35.71 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  36.22 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  39.53 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  39.53 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  39.53 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  31.73 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  35.85 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  33.11 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  31.97 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  37.3 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  39.42 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  37.3 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  38.76 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  37.88 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>