More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1546 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  52.4 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  51.58 
 
 
222 aa  215  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  50.23 
 
 
211 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  45.13 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  47.68 
 
 
235 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  44.75 
 
 
225 aa  187  9e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  45.33 
 
 
231 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_002950  PG0778  hypothetical protein  44.98 
 
 
239 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  41.7 
 
 
228 aa  168  7e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  37.29 
 
 
244 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  36.28 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  35.43 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  32.16 
 
 
227 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  34.21 
 
 
239 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  34.82 
 
 
232 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  34.82 
 
 
232 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  34.82 
 
 
232 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  30.84 
 
 
228 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  28.7 
 
 
226 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  28.7 
 
 
226 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  31.25 
 
 
233 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  31.88 
 
 
224 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  30.45 
 
 
227 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  31.88 
 
 
224 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  31.91 
 
 
238 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.88 
 
 
231 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.88 
 
 
231 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.88 
 
 
231 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  32.89 
 
 
233 aa  99  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  29.61 
 
 
224 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  29.82 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  31.88 
 
 
231 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  31.88 
 
 
231 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  41.98 
 
 
238 aa  99  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  29.66 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  31.58 
 
 
231 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  30.8 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  30.51 
 
 
224 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  31.58 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  31.58 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  38.32 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  31.58 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  31.58 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.14 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  34.5 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  27.63 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  31.11 
 
 
239 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  31.7 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  38.37 
 
 
241 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  27.39 
 
 
235 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  32.57 
 
 
231 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
233 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.58 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  30.32 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  31.11 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.62 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  28.33 
 
 
224 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  32.76 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  29.05 
 
 
224 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.17 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  32.16 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  26.64 
 
 
238 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  38.41 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  30.7 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  30.7 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  32.95 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  32.14 
 
 
236 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  33.73 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  32.95 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
233 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  35.61 
 
 
239 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  27.95 
 
 
236 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  28.95 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1236  peptidase M22 glycoprotease  28.77 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  30.7 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  34.64 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  29.36 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  30.7 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.36 
 
 
456 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  29.61 
 
 
222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  28.7 
 
 
231 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  29.61 
 
 
222 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  40.6 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  35.86 
 
 
231 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  30.43 
 
 
230 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  38.36 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  36.14 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  28.63 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  33.57 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  28.81 
 
 
247 aa  85.1  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  28.76 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  30.97 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  37.88 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  27.6 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>