More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0586 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 		 230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  92.95 
 
 		 231 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  82.68 
 
 		 231 aa  328  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  70.56 
 
 		 232 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  68.89 
 
 		 232 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  70.98 
 
 		 231 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  69.82 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  54.5 
 
 		 227 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  47.01 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  51.1 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  48.29 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  46.89 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  47.49 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  49.34 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  41.13 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  47.6 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  42.6 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  42.49 
 
 		 229 aa  151  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  45.33 
 
 		 218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  47.79 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  39.37 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  39.37 
 
 		 261 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  37.1 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  41.55 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36.99 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  39.13 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  41.6 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  43.3 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.22 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  33.05 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  42.97 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  43.53 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.48 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  39.37 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  32.95 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  36.31 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  39.1 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  33.51 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  37.8 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.8 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  39.2 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  37.01 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  37.01 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  37.14 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  38.4 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  37.01 
 
 		 231 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  37.6 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  38.4 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  38.4 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  38.4 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  39.2 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  32.7 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.97 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  38.35 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  35.97 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  38.4 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  37.23 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  26.55 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  38.4 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  32.42 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  32.14 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  40.15 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  35.07 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  35.04 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  29.61 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  35.25 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  37.56 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  33.48 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  32.22 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  35.77 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  34.07 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  31.36 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  41.23 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.92 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  43.14 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  41.23 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  37.98 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.21 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  33.48 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  35.04 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>