More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3357 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  80.36 
 
 		 224 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  79.91 
 
 		 224 aa  357  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  79.91 
 
 		 224 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  79.46 
 
 		 224 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  78.03 
 
 		 224 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  77.58 
 
 		 224 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  77.58 
 
 		 224 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  75.89 
 
 		 226 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  75 
 
 		 226 aa  332  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  75.78 
 
 		 225 aa  314  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  56.65 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  54.55 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  53.28 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  52.63 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  52.79 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  52.79 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  52.79 
 
 		 232 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  48.48 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  50.44 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  50.44 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  50.44 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  50.44 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  50.44 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  47.35 
 
 		 233 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  49.12 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  48.7 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  48.7 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  48.26 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  48.26 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  48.26 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  48.26 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  49.78 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  48.26 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  47.83 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  48.7 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  49.56 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  46.02 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  48.68 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  48.5 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  49.78 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  46.84 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  46.02 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  45.58 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  45.65 
 
 		 234 aa  187  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  45.58 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  46.46 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  45.58 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  44.44 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  45.58 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  46.09 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  44 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  41.82 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  44.25 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  41.82 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  47.14 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  42.8 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  47.75 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  44 
 
 		 238 aa  175  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  40.44 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  48.13 
 
 		 266 aa  175  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  43.75 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  47.96 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  43.3 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  43.3 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  43.3 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  47.75 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  47.51 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  45.92 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  41.33 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  44.55 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  44.49 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  40.52 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  40.09 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  37.71 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  44.08 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  37.22 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  47.14 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  42.79 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  40.81 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  40.57 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  35.87 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  42.32 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.53 
 
 		 229 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  41.35 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  42.42 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  41.28 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  41.28 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2210  hypothetical protein  43.62 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  38.82 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  41.28 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1582  glycoprotease family protein  38.59 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  38.59 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1946  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2077  peptidase M22, glycoprotease  40.43 
 
 		 255 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  36.07 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  42.86 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2084  glycoprotease family protein  38.49 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.113679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1357  glycoprotease family protein  38.49 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0779357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>