More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0530 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
197 aa  384  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  51.44 
 
 
215 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  55.98 
 
 
202 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  55.98 
 
 
202 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  43.52 
 
 
215 aa  141  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  53.76 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2840  peptidase M22  58.22 
 
 
218 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000908418  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  46.4 
 
 
232 aa  94  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  37.11 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  36.72 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  38.64 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  37.76 
 
 
240 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  32.41 
 
 
229 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  38.28 
 
 
213 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  38.58 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  40.16 
 
 
231 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  38.58 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  31.19 
 
 
220 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  33.01 
 
 
220 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  28.96 
 
 
237 aa  84.7  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  32.72 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  37.41 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  34.4 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  33.03 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  38.58 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  35.21 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  36 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  36 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  36 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  30.04 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  30.04 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  28.96 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  29.41 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  38.46 
 
 
235 aa  78.2  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  42.75 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  38.89 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  38.58 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  37.01 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  32.43 
 
 
232 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  36 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  36 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  36.8 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  28.57 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  34.03 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  36.8 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  37.01 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  36.8 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  31.22 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  37.01 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  41.24 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  36 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  33.5 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  34.4 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  34.4 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  35.2 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  35.2 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  35.2 
 
 
231 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  35.2 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  35.2 
 
 
231 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  36.8 
 
 
236 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  35.2 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  35.2 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  35.2 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  35.2 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  32.12 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  35.2 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  32.28 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  35.48 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  34.88 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  32.3 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  30.39 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  31.93 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  30.8 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  37.3 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  27.85 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  33.04 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  35.77 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  36.73 
 
 
236 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  36.15 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  38.64 
 
 
231 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  35.77 
 
 
233 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.69 
 
 
233 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  31.71 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  30.04 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  32.82 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  32.14 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  30.32 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  29.41 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  34.4 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  33.54 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  36.36 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  39.06 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  31.86 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  30.88 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>