More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2604 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  67.12 
 
 
225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  56.52 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  55.41 
 
 
218 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  57.89 
 
 
230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  52.87 
 
 
240 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  49.56 
 
 
216 aa  157  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  46.98 
 
 
225 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  50.23 
 
 
210 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  48.37 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  47.62 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  44.11 
 
 
287 aa  151  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  45.5 
 
 
212 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  42.92 
 
 
207 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  43.81 
 
 
223 aa  149  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  42.22 
 
 
223 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  47.71 
 
 
210 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  48.1 
 
 
232 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  44.19 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  45.75 
 
 
243 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  43.86 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  41.78 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  45.45 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.43 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  43.64 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  40.17 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  43.46 
 
 
241 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  44.5 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  40.85 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  40.6 
 
 
229 aa  114  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  40.99 
 
 
213 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  40.44 
 
 
223 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  37.65 
 
 
248 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  32.48 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  35.89 
 
 
215 aa  98.6  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  35.68 
 
 
215 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  35.11 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0810  peptidase M22, glycoprotease  33.64 
 
 
223 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0915  peptidase M22, glycoprotease  31.22 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.93 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  30.25 
 
 
241 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  26.01 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  28.21 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.98 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  34.07 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  31.84 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  29.18 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  40.61 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  29.15 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  40.15 
 
 
891 aa  85.9  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  37.12 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  37.12 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  37.12 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  30.49 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  27.8 
 
 
223 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  35.61 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  31.98 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  34.51 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  36.36 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  36.36 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  28.51 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  36.36 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  36.36 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  36.36 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  29.6 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  36.36 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  36.36 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  28.82 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  38.85 
 
 
230 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  35.45 
 
 
213 aa  82  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  34.48 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  35.61 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  30.77 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  36.43 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  39.57 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  41.54 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  34.96 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  29.29 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.92 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02240  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.91 
 
 
781 aa  79.7  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  36.32 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  29.18 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1344  peptidase M22 glycoprotease  45.19 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309831  normal  0.0951172 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  34.21 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  35.53 
 
 
232 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  36.84 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  28.96 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  32.16 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>