More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1000 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
218 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2604  hypothetical protein  55.41 
 
 
231 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4263  peptidase M22 glycoprotease  58.33 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  58.64 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  52.38 
 
 
227 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  55.16 
 
 
225 aa  184  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0614  peptidase M22 glycoprotease  53.09 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725915  normal  0.446641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3663  peptidase M22, glycoprotease  52.05 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07480  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  48.9 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.308206  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  50.45 
 
 
225 aa  165  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  49.78 
 
 
232 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3853  peptidase M22, glycoprotease  48.21 
 
 
225 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04630  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.93 
 
 
207 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47382  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4243  peptidase M22 glycoprotease  45.78 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0145677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0627  peptidase M22, glycoprotease  46.73 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4931  peptidase M22, glycoprotease  46.54 
 
 
210 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6007  peptidase M22 glycoprotease  42.48 
 
 
287 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.463097  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0562  peptidase M22 glycoprotease  46.85 
 
 
218 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.849533  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1487  peptidase M22, glycoprotease  47.44 
 
 
210 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1149  peptidase M22, glycoprotease  46.41 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.745666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1166  peptidase M22, glycoprotease  46.41 
 
 
211 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.533647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1176  peptidase M22, glycoprotease  46.41 
 
 
211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0451061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4457  peptidase M22 glycoprotease  45.29 
 
 
212 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2894  peptidase M22, glycoprotease  43.56 
 
 
223 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29230  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  44.84 
 
 
224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2604  peptidase M22 glycoprotease  43.17 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000523525 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  42.19 
 
 
241 aa  131  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  40.77 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2598  peptidase M22 glycoprotease  43.64 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0896201  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  42.99 
 
 
191 aa  128  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  42.86 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13455  hypothetical protein  46.89 
 
 
215 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00396413  hitchhiker  0.000602893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16700  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  46.26 
 
 
223 aa  123  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.568455  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1202  peptidase M22 glycoprotease  41.43 
 
 
248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3071  peptidase M22 glycoprotease  42.79 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.255887  normal  0.552992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23140  putative molecular chaperone, inactive metal-dependent protease like protein  41.95 
 
 
244 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  30.99 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  33.19 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  41.86 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  42.11 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  37.13 
 
 
250 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  33.65 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  34.68 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  38.4 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  35 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  31.4 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  28.96 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.1 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.1 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  31.11 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.1 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  42.52 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  32.03 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  40.15 
 
 
891 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.1 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  29.52 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.58 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  36.99 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  30.63 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  30.63 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  33.53 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  30.63 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  33.53 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  30.63 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  30.63 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  32.95 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  32.95 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  30 
 
 
222 aa  79  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  32.95 
 
 
231 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  25.89 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  40.16 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  28.91 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  32.45 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  31.53 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  31.41 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  39.39 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  32.58 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  33.86 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  33.86 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.86 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  34.63 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.86 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  28.05 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  30.36 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  37.88 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  31.41 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11790  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.59 
 
 
860 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  33.86 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  31.96 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  33.94 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  35 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  33.86 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  32.95 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  33.86 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  33.85 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  29.96 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1344  peptidase M22 glycoprotease  41.27 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309831  normal  0.0951172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  34.36 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>