More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3763 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 		 232 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  42.92 
 
 		 231 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  40.18 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  39.73 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  43.42 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  43.53 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  37.73 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  42.92 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  37.73 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  41.55 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  39.29 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  39.75 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  41.41 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  41.92 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0530  peptidase M22, glycoprotease  46.4 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  37 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  46.56 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  39.21 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  37.23 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  36.62 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  41.38 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  35.74 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  34.09 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  35.19 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2213  hypothetical protein  49.19 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0888  peptidase M22, glycoprotease  49.19 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0332753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  36.15 
 
 		 220 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3029  peptidase M22, glycoprotease  40.19 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  38.1 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000150711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  41.92 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  37.44 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  35.56 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  40.48 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  35.56 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  35.56 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2280  peptidase M22, glycoprotease  47.58 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal  0.567349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  38.6 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  35.56 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  41.74 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  35.56 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  35.25 
 
 		 236 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  36.64 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0731  peptidase M22 glycoprotease  40.09 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0874562  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  37.61 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  34.81 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  34.86 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  36.75 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  39.06 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  37.59 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6548  peptidase M22 glycoprotease  38.79 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.437116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.28 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  46.24 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  36.57 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1714  peptidase M22 glycoprotease  37.71 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  35.29 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  31.03 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  39.84 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  37.88 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  37.3 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  37.59 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  33.86 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  32.61 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  38.28 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0358  peptidase M22, glycoprotease  37.96 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0837171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.61 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  34.35 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  34.56 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  37.9 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  34.56 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  34.56 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.94 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  36.61 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  35.94 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  36.72 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  30.95 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  32.93 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0883  peptidase M22 glycoprotease  35.38 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0111529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2069  peptidase M22, glycoprotease  42.52 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513401  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  36.57 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  35.38 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  28.24 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  27.83 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  0.00000000126844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  37.82 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  35.43 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1000  peptidase M22 glycoprotease  37 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  32.34 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>