More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1913 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  100 
 
 
230 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  69.57 
 
 
230 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  60.96 
 
 
228 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  56.09 
 
 
230 aa  225  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2748  peptidase M22 glycoprotease  57.14 
 
 
237 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  48.94 
 
 
240 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  46.93 
 
 
229 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  45.18 
 
 
233 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  46.26 
 
 
250 aa  171  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  40.26 
 
 
228 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  34.91 
 
 
236 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  36.4 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  37 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  37.61 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  37.61 
 
 
234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  37.84 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  36.96 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  34.22 
 
 
236 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  33.77 
 
 
236 aa  124  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  35.34 
 
 
246 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  36.68 
 
 
230 aa  121  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  37.45 
 
 
235 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  36.55 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  34.07 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  36.21 
 
 
246 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  36.24 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  36.24 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  36.24 
 
 
230 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  35.81 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  34.51 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  35.81 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  35.81 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  33.91 
 
 
239 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  37.45 
 
 
238 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  33.92 
 
 
233 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.24 
 
 
229 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  32.89 
 
 
241 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.63 
 
 
233 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0445  peptidase M22 glycoprotease  30.22 
 
 
221 aa  99  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  33.03 
 
 
226 aa  99  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  34.25 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  32.27 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  33.33 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  32.57 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0618  peptidase M22 glycoprotease  32.89 
 
 
229 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  33.62 
 
 
235 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  34.06 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5298  peptidase M22 glycoprotease  35.09 
 
 
276 aa  95.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.355129  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  34.73 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  30.04 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  31.72 
 
 
233 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  36.07 
 
 
228 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  35.11 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  35.11 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1778  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  32.16 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  34.5 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  34.38 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  32.61 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  37.29 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  31.65 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  32.13 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  33.18 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  37.75 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  38.89 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  40.14 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.23 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  32.74 
 
 
229 aa  89  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  40.14 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  29.82 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  36.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  35.56 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  36.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  36.9 
 
 
231 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  32.3 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  38.36 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  37.93 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  31.72 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  32.43 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  39.46 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  36.9 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  32.42 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  39.35 
 
 
226 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  36.9 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  33.03 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  31.98 
 
 
237 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  40.94 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  31.98 
 
 
237 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.73 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  34.97 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  31.28 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  33.73 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  37.85 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  34.64 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  37.67 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  40.31 
 
 
237 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  31.84 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>