114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3380 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  39.32 
 
 		 242 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  36.06 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  37.74 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  37.11 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  35.85 
 
 		 297 aa  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  37.11 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  37.08 
 
 		 225 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  31.84 
 
 		 257 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  36.62 
 
 		 222 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  41.54 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  36.36 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  35.84 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  30.36 
 
 		 225 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  34.87 
 
 		 233 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  35.26 
 
 		 231 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  36.96 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  34.68 
 
 		 231 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  33.74 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  32.56 
 
 		 229 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  34.88 
 
 		 230 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  30.99 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  32.83 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  30.54 
 
 		 238 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.29 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  30.93 
 
 		 260 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  33.75 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  36.69 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30.94 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  30.99 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  35.53 
 
 		 200 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  36.63 
 
 		 198 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  36.21 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  36.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  35.2 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  32.94 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  34.71 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  34.71 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  34.71 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  26.04 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  32.95 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  33.92 
 
 		 196 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  35.53 
 
 		 196 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  34.71 
 
 		 195 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  33.93 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  33.91 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  29.95 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  33.91 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  32.54 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  35.34 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  31.98 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  33.53 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  30.85 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  33.53 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  32.37 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  36.5 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  28.74 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  26.88 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  33.78 
 
 		 195 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  31.03 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  33.14 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  29.93 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  36.69 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.06 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 242 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  36.59 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  32.35 
 
 		 187 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  34.81 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  31.06 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 		 663 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  31.37 
 
 		 194 aa  53.1  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>