More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1400 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  51.23 
 
 		 175 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  53.46 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  53.25 
 
 		 169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  49.65 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  47.52 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.44 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  44.52 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  46.81 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  46.21 
 
 		 155 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  44.08 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  45 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  41.72 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  42.11 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  41.78 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  40 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  40.28 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  38.93 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  40.28 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  43.66 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  38.16 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  37.5 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5776  CheW protein  45.83 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.727432  normal  0.120994 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  41.26 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.75 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  42.25 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  41.26 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  39.31 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  36.71 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  42.25 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  39.31 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  45.14 
 
 		 189 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  41.55 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  39.44 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  42.55 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.86 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  39.57 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  40.56 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  40.56 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  41.67 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  42.11 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  42.11 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  41.45 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  39.74 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  42.54 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  37.59 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  37.82 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  38.57 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  39.58 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  37.14 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  36.94 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  36.36 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  34.84 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  35.25 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  33.58 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  35.66 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  35.66 
 
 		 194 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.32 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  30.67 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.57 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.06 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  34.64 
 
 		 185 aa  91.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.88 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.82 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  34.03 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  30.07 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.9 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.9 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  29.93 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0237  putative CheW protein  35.97 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1585  chemotaxis protein, CheW2  35.97 
 
 		 163 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  37.96 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  37.96 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  35.21 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.76 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  32.65 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  35.33 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.09 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.17 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  37.9 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.47 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.37 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.37 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.19 
 
 		 167 aa  84.3  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  84.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  30.32 
 
 		 169 aa  84  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.79 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.77 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  36.03 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  35.29 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.37 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.77 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.37 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  34.93 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  36.17 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.37 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  35.48 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>