191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2093 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  100 
 
 		 668 aa  1340    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  96.11 
 
 		 668 aa  1278    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  31.71 
 
 		 673 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  32.47 
 
 		 679 aa  236  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  29.62 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4056  peptidase S15  30.81 
 
 		 655 aa  216  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.37 
 
 		 678 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4675  peptidase S15  28.77 
 
 		 615 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  25.96 
 
 		 547 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.21 
 
 		 550 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6346  peptidase S15  26.58 
 
 		 612 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  27.26 
 
 		 576 aa  158  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.91 
 
 		 595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  27.83 
 
 		 644 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  28 
 
 		 595 aa  153  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  26 
 
 		 663 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4945  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.14 
 
 		 605 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0518837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4534  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 609 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.32 
 
 		 570 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  25.8 
 
 		 677 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.84 
 
 		 594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.72 
 
 		 577 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.3 
 
 		 550 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  25.63 
 
 		 668 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  26.01 
 
 		 670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.33 
 
 		 679 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.01 
 
 		 561 aa  132  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3343  putative acylase  23.76 
 
 		 636 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.843899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1732  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.08 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116958  hitchhiker  0.00967983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.27 
 
 		 674 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1796  peptidase S15  26.1 
 
 		 569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.53 
 
 		 629 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3305  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.14 
 
 		 611 aa  127  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.0581087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  25.28 
 
 		 571 aa  127  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 611 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  24.01 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  24.04 
 
 		 670 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  24.15 
 
 		 714 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.92 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  25.59 
 
 		 668 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  26.04 
 
 		 673 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  29.31 
 
 		 690 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  23.13 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  23.32 
 
 		 641 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  25.24 
 
 		 705 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  24.87 
 
 		 677 aa  120  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  25.27 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.69 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  25.05 
 
 		 677 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  22.5 
 
 		 542 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.23 
 
 		 625 aa  117  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  25.59 
 
 		 680 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  23.33 
 
 		 667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  26.01 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.73 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  26.69 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  23.45 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2616  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2670  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.29 
 
 		 560 aa  115  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  24.95 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.26 
 
 		 568 aa  114  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  25.39 
 
 		 618 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  27.59 
 
 		 558 aa  113  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  24.87 
 
 		 674 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  30.75 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  24.36 
 
 		 667 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  25.05 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.43 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  24.54 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  24.54 
 
 		 541 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  23.93 
 
 		 690 aa  110  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.43 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  24.7 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  23.61 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  23.94 
 
 		 638 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5053  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.75 
 
 		 561 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842061  normal  0.996249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.63 
 
 		 546 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  24.37 
 
 		 630 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  23.92 
 
 		 625 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  24.53 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3114  peptidase S15  25.61 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.976266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1499  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124334  normal  0.885769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4096  peptidase S15  26.99 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3635  peptidase S15  24.55 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.958468  normal  0.454344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  25.51 
 
 		 534 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  23.3 
 
 		 542 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.53 
 
 		 524 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2615  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.72 
 
 		 599 aa  100  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465007  normal  0.945434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1772  putative esterase  23.68 
 
 		 598 aa  99.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0442239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  22.89 
 
 		 580 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11864  hypothetical protein  24.17 
 
 		 628 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.488629  normal  0.930954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  27.63 
 
 		 670 aa  97.8  6e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  29.82 
 
 		 499 aa  97.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  26.15 
 
 		 670 aa  97.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3036  hypothetical protein  28.96 
 
 		 667 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5294  peptidase S15  25.56 
 
 		 599 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5443  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.66 
 
 		 625 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6822  peptidase S15  29.12 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  22.77 
 
 		 678 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3763  peptidase S15  28.96 
 
 		 667 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>