More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0022 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
156 aa  319  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  95.54 
 
 
157 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.07 
 
 
283 aa  216  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  208  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.03 
 
 
150 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
155 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  60.66 
 
 
153 aa  154  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.29 
 
 
146 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  48.2 
 
 
149 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.2 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.36 
 
 
152 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.75 
 
 
152 aa  133  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.9 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.48 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.48 
 
 
145 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.71 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.76 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
143 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.48 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
145 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  41.06 
 
 
153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.88 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  44.44 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.61 
 
 
152 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.1 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.38 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.45 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  44.93 
 
 
159 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.77 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.24 
 
 
159 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
159 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.52 
 
 
159 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 
159 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.89 
 
 
159 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
143 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.43 
 
 
157 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
159 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
151 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  39.58 
 
 
144 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  39.58 
 
 
144 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.96 
 
 
144 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.22 
 
 
159 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
157 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.96 
 
 
144 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.96 
 
 
144 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.96 
 
 
144 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.96 
 
 
144 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
159 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
159 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.07 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.93 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.01 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.51 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.41 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.13 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  41.61 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.41 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.18 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.88 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  45 
 
 
158 aa  116  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.97 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  38.41 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.74 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  41.72 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  39.42 
 
 
145 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.43 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  41.43 
 
 
157 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.1 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  34.72 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.1 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  37.16 
 
 
167 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.3 
 
 
152 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  44.06 
 
 
152 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  41.55 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  41.55 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
157 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 
151 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>