More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1746 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 425 aa  852    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  85.65 
 
 		 425 aa  725    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3544  glutamyl-tRNA reductase  47.13 
 
 		 414 aa  358  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.037813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  38.69 
 
 		 443 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1288  glutamyl-tRNA reductase  40.77 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0360  glutamyl-tRNA reductase  37.91 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3233  glutamyl-tRNA reductase  38.19 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000271435  normal  0.234997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3284  glutamyl-tRNA reductase  38.42 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  38.63 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0870  glutamyl-tRNA reductase  39.06 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1228  glutamyl-tRNA reductase  37.96 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3238  glutamyl-tRNA reductase  37.47 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.173569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  36.79 
 
 		 443 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  36.93 
 
 		 464 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0503  glutamyl-tRNA reductase  38.57 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000781545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0407  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 		 436 aa  272  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0407  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  34.27 
 
 		 458 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16841  glutamyl-tRNA reductase  37.3 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1250  glutamyl-tRNA reductase  40.6 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.305769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1260  glutamyl-tRNA reductase  39.48 
 
 		 436 aa  269  8.999999999999999e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.497201  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1254  glutamyl-tRNA reductase  37.73 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.094771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 		 458 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0174  glutamyl-tRNA reductase  35.89 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08061  glutamyl-tRNA reductase  35.91 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.752768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3644  glutamyl-tRNA reductase  38.15 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000014182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  33.65 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  40.14 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09941  glutamyl-tRNA reductase  35.9 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  36.34 
 
 		 464 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  34.12 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  33.89 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08301  glutamyl-tRNA reductase  34.8 
 
 		 436 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08281  glutamyl-tRNA reductase  34.34 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  36.6 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  33.18 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  37.83 
 
 		 446 aa  255  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08151  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.374123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  36.41 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  37.12 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0776  glutamyl-tRNA reductase  33.95 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1618  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  38.59 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1374  glutamyl-tRNA reductase  39.2 
 
 		 440 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12380  glutamyl-tRNA reductase  36.3 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  39.95 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  36.1 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0356  glutamyl-tRNA reductase  38.68 
 
 		 455 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3699  glutamyl-tRNA reductase  35.22 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01249  glutamyl-tRNA reductase  35.71 
 
 		 418 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3355  glutamyl-tRNA reductase  34.52 
 
 		 443 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.811107  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1979  glutamyl-tRNA reductase  40.38 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.001246  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  33.57 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004204  glutamyl-tRNA reductase  35.48 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000179715  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  37.13 
 
 		 438 aa  243  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0426  glutamyl-tRNA reductase  38.92 
 
 		 455 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2775  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0800  glutamyl-tRNA reductase  36.67 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  35.51 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0296  glutamyl-tRNA reductase  36.28 
 
 		 442 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3170  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000428438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  37.98 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0695  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000150429  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0768  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000952775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3738  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000445074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3547  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000884413  decreased coverage  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  36.04 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3615  glutamyl-tRNA reductase  36.43 
 
 		 416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000229913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0796  glutamyl-tRNA reductase  36.19 
 
 		 416 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000467609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1423  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  40 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.96 
 
 		 419 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  34.88 
 
 		 442 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1296  glutamyl-tRNA reductase  34.04 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0722  glutamyl-tRNA reductase  35.54 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.131936  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  37.5 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3834  glutamyl-tRNA reductase  35.78 
 
 		 416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1465  glutamyl-tRNA reductase  36.72 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.68367  normal  0.0496513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  37.44 
 
 		 432 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  37.93 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3200  glutamyl-tRNA reductase  38.41 
 
 		 450 aa  236  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 432 aa  236  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61710  glutamyl-tRNA reductase  36.71 
 
 		 422 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624585  normal  0.0109768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  35.56 
 
 		 446 aa  235  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  36.41 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  37.19 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>