More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5537 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5537  dehydratase, MaoC-like domain-containing protein  100 
 
 
157 aa  328  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0232  dehydratase  59.18 
 
 
156 aa  186  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4847  dehydratase  45.27 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6290  MaoC domain protein dehydratase  44.83 
 
 
162 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16324  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6312  MaoC domain protein dehydratase  44.78 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3869  MaoC-like dehydratase  41.89 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4109  dehydratase  39.86 
 
 
150 aa  107  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294085  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1857  MaoC domain protein dehydratase  39.58 
 
 
149 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2626  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.76 
 
 
684 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574883  normal  0.162198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3090  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  43.71 
 
 
684 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.748677  hitchhiker  0.00334678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3071  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.82 
 
 
690 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.329771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3270  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
684 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2489  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  41.72 
 
 
684 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.997274 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2639  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.61 
 
 
683 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.31992  normal  0.197677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0649  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.07 
 
 
683 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.940422  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2258  phenylacetic acid degradation protein paaN  38.99 
 
 
681 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2268  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.99 
 
 
681 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1474  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.99 
 
 
681 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1572  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  38.36 
 
 
681 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1539  dehydratase  35.37 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  36.73 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4127  dehydratase  43.28 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3568  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  39.62 
 
 
682 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.282162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1850  phenylacetic acid degradation protein paaN  35.06 
 
 
679 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8142  normal  0.547776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1515  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.67 
 
 
686 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629181  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.94 
 
 
686 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7289  MaoC-like dehydratase  37.84 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0226  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  37.82 
 
 
683 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2642  MaoC-like dehydratase  37.84 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2956  MaoC domain protein dehydratase  38.28 
 
 
148 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2706  MaoC-like dehydratase  37.58 
 
 
150 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2751  MaoC domain protein dehydratase  40.3 
 
 
146 aa  84  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1877  dehydratase  36.49 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3102  MaoC domain protein dehydratase  39.34 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000477057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2290  MaoC-like dehydratase  37.58 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0031  dehydratase  35.62 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.109273  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4357  MaoC domain protein dehydratase  37.12 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0411099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2320  MaoC domain protein dehydratase  34.51 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  37.19 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  33.56 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2272  dehydratase  42.42 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2898  MaoC domain protein dehydratase  35.88 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  32.89 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1556  phenylacetic acid degradation protein paaN  36.54 
 
 
690 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7153  MaoC-like dehydratase  35.57 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851321  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1030  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1913  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  33.56 
 
 
695 aa  77.4  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0600585  normal  0.0559603 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2683  dehydratase  36.17 
 
 
154 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1641  MaoC-like dehydratase  34.01 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204847  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  32.41 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0934  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
691 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  40.6 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1286  MaoC dehydratase  35.88 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  35.56 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4804  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
686 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0316  dehydratase  39.85 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2549  dehydratase  38.64 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0407782  normal  0.257026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5038  MaoC domain protein dehydratase  33.78 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  34.81 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12521  oxidase regulatory-like protein  34.93 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2103  MaoC domain protein dehydratase  31.76 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.598637  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3633  dehydratase  32.24 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635263  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3701  dehydratase  32.24 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3628  MaoC-like dehydratase  32.24 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3359  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
685 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.990834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3435  MaoC domain protein dehydratase  34.07 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0658  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  36.03 
 
 
664 aa  71.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6403  dehydratase  32.19 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2315  dehydratase  33.55 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0892641  normal  0.0374532 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3849  MaoC domain protein dehydratase  32.9 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.928689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  33.56 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  31.85 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3489  MaoC domain protein dehydratase  39.47 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  31.85 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1925  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.53 
 
 
679 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0838003  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5530  MaoC-like dehydratase  32.19 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5894  dehydratase  32.19 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36432  normal  0.974652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0292  MaoC domain protein dehydratase  33.55 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26540  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  32.64 
 
 
681 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.212629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3636  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
678 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0907  bifunctional aldehyde dehydrogenase/enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
687 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338542  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5510  MaoC domain protein dehydratase  32.41 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.427484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  31.94 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  31.94 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4088  dehydratase  30.92 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0156653  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3912  dehydratase  31.76 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.675333  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6022  dehydratase  32.41 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.447849 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3292  MaoC-like dehydratase  31.51 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1652  MoaC domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1726  MoaC domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0702  MoaC domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2304  Acyl dehydratase  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.69727  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1933  MoaC domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2924  MaoC-like dehydratase  31.47 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.45225  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2221  Acyl dehydratase  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0607  MaoC-like dehydratase  34.07 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0609  MaoC domain-containing protein  31.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2555  dehydratase  30.92 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1254  MaoC-like protein dehydratase  31.58 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.373696  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  33.33 
 
 
344 aa  67.8  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>