113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3083 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  65.13 
 
 		 192 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  54.31 
 
 		 194 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  55.78 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  54.82 
 
 		 194 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  56.82 
 
 		 200 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  55.56 
 
 		 196 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  56.06 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  58.86 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  52.06 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  51.27 
 
 		 195 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  51.27 
 
 		 195 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  55.23 
 
 		 195 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  51.26 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  50.76 
 
 		 195 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  53.59 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  49.74 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  50.76 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  50.76 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  50.25 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  51.02 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  51.02 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  51.02 
 
 		 195 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  51.53 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  49.75 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  52.84 
 
 		 194 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  52.84 
 
 		 194 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  52.84 
 
 		 194 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  51.02 
 
 		 195 aa  188  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  50.51 
 
 		 195 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  52.84 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  53.67 
 
 		 194 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 194 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  51.65 
 
 		 194 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  50.57 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  48.72 
 
 		 195 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  48.84 
 
 		 194 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  45.41 
 
 		 196 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  49.11 
 
 		 194 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  38.85 
 
 		 191 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  39.1 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  37.2 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  39.74 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  39.1 
 
 		 188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  37.58 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.2 
 
 		 190 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  39.89 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  46.28 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  36.6 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  38.92 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  40.62 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  35.94 
 
 		 185 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  36.69 
 
 		 327 aa  85.1  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  38.73 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  32.74 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  31.4 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  30.17 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  36.8 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  30.23 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  34.88 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  33.56 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  32.03 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  31.5 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  33.59 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  30.47 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  33.06 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  31.13 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  31.5 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  28.49 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  33.55 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  29.6 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  33.06 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  26.83 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30.43 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  33.62 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  30.82 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  31.62 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  27.34 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  24.71 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  31.08 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>