More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2448 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  459  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  80.7 
 
 		 228 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  72.25 
 
 		 243 aa  325  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  71.11 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  71.11 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  65.33 
 
 		 220 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  65.33 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  63.56 
 
 		 220 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  63.72 
 
 		 220 aa  274  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  64.44 
 
 		 220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  64.44 
 
 		 220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  62.67 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  64 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  64.89 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  64 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  58.67 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  58.67 
 
 		 254 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  58.93 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  52.04 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  36.24 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  40.17 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  37.13 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  37.08 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  34.39 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  40.98 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  40.98 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  40.98 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  40.98 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  41.21 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  40.98 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  40.44 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  34.5 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  36.44 
 
 		 218 aa  95.1  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  48.45 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  44.14 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  31.6 
 
 		 216 aa  85.5  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.36 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  36.07 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  37.6 
 
 		 426 aa  79.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  40.18 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.45 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  43 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  32.63 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  36.54 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  28.81 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  27.63 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25.75 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  44.23 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  38.38 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  40.38 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  30.51 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  38.61 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  28.87 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  38 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.4 
 
 		 209 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  28.8 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  28.8 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.35 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.55 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.29 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  29.69 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  35.92 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.6 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  31.64 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  37.16 
 
 		 375 aa  68.2  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  31.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  42 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  44.79 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  38.54 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  38 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  30.22 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  41.35 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  39.58 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  41.67 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  40.66 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  38.4 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  40 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  37.37 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  38.4 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  38.4 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  37.25 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  33.52 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  30.8 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  31.45 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  38.24 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  38.24 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  37.37 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  38.24 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  38.24 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  32.62 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>