234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1202 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 175 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  78.01 
 
 		 203 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  76.22 
 
 		 145 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  76.22 
 
 		 145 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  76.22 
 
 		 145 aa  227  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  77.86 
 
 		 145 aa  226  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  75.52 
 
 		 145 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  74.83 
 
 		 145 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.79 
 
 		 149 aa  224  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  77.21 
 
 		 181 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  77.21 
 
 		 181 aa  223  8e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  77.21 
 
 		 149 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  77.21 
 
 		 149 aa  223  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  77.21 
 
 		 149 aa  223  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  78.36 
 
 		 149 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  72.19 
 
 		 163 aa  221  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  75.89 
 
 		 147 aa  217  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  75.89 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  62.05 
 
 		 164 aa  215  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 		 150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  68.53 
 
 		 153 aa  210  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  69.66 
 
 		 149 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  67.36 
 
 		 162 aa  205  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 162 aa  204  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  67.83 
 
 		 145 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  75.78 
 
 		 153 aa  200  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 		 145 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 		 147 aa  195  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  66.2 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  60.99 
 
 		 148 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  78.95 
 
 		 125 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  61.97 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  63.24 
 
 		 153 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  63.24 
 
 		 153 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  59.15 
 
 		 143 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  60.28 
 
 		 153 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  59.15 
 
 		 143 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  58.45 
 
 		 144 aa  181  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  58.57 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  57.64 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  56.72 
 
 		 136 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  58.39 
 
 		 147 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 143 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  57.55 
 
 		 147 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 137 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  57.04 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  57.34 
 
 		 143 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  59.4 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  59.56 
 
 		 142 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  53.68 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 		 150 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  54.48 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  52.03 
 
 		 155 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 		 147 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 		 147 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  48.95 
 
 		 147 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  47.48 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  46.4 
 
 		 145 aa  138  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  47.55 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  44.12 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  34.62 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 146 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  30.94 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  33.07 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  33.87 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.85 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  30.5 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  34.4 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  30.58 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>