More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0080 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0110  enoyl-CoA hydratase  92.51 
 
 		 277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  85.82 
 
 		 272 aa  484  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  86.57 
 
 		 272 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  86.57 
 
 		 272 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  77.66 
 
 		 286 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  79.01 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  78.93 
 
 		 275 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  78.93 
 
 		 275 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  79.01 
 
 		 295 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  78.93 
 
 		 275 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  78.16 
 
 		 275 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  77.78 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  77.39 
 
 		 275 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  77.01 
 
 		 275 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  74.14 
 
 		 275 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  73.76 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  73.76 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  73.76 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  73.76 
 
 		 275 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  73.38 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  73.38 
 
 		 275 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0363  enoyl-CoA hydratase  76.03 
 
 		 249 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3643  enoyl-CoA hydratase  71.48 
 
 		 265 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  66.27 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3006  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  65.73 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2750  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.5 
 
 		 268 aa  345  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7280  enoyl-CoA hydratase  64.26 
 
 		 281 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3993  enoyl-CoA hydratase  65.13 
 
 		 260 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169816  normal  0.366348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12694  enoyl-CoA hydratase  59.36 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  54.78 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0287  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.94 
 
 		 270 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5283  enoyl-CoA hydratase  56.09 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1633  enoyl-CoA hydratase/isomerase  57.51 
 
 		 266 aa  251  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 		 269 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 		 267 aa  172  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0354  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000842665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.27 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0515  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4150  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.135617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.72 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 262 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.69 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  32.49 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.56 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1840  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.62 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4253  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.43 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.22 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6922  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.63 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.68 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  28.63 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3892  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3818  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.13 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3804  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726553  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.72 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.41 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  30.97 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  31.42 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  31.76 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  29.07 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  31.06 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  30.32 
 
 		 266 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  29.06 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  33.02 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4044  enoyl-CoA hydratase  30.91 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.987493  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.69 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  28.51 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.87 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  27.82 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  26.79 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.9 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.92 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  31.22 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.46 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  26.34 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.09 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.66 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  32.03 
 
 		 661 aa  96.3  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2359  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  29.8 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  27.51 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  30.43 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.2 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3285  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.96 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>