More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2631 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2631  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.87866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.41 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0478  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.92 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1238  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.56 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.05 
 
 		 197 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1374  NADH dehydrogenase I chain I  38.26 
 
 		 175 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00228535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.64 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.999472 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3865  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.13 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1962  NADH dehydrogenase subunit I  34.18 
 
 		 163 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.528282  normal  0.0448739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.76 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1660  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.85 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.74 
 
 		 165 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  37.93 
 
 		 162 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4074  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.97 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0825  NADH dehydrogenase subunit I  35.1 
 
 		 163 aa  99.8  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0554  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1609  NADH dehydrogenase subunit I  34.97 
 
 		 163 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  35.46 
 
 		 163 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.82 
 
 		 165 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1536  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.57 
 
 		 170 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1956  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.18 
 
 		 162 aa  98.6  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0346  NADH dehydrogenase I, I subunit  38.89 
 
 		 132 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  39.57 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  39.01 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1411  NADH dehydrogenase subunit I  33.56 
 
 		 165 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  41.98 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.13 
 
 		 168 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  41.22 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  38.85 
 
 		 182 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  42.75 
 
 		 176 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0164  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 8  36.84 
 
 		 165 aa  96.3  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  36.81 
 
 		 177 aa  95.9  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3918  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 		 132 aa  96.3  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4002  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.89 
 
 		 132 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.89067e-17 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  35.04 
 
 		 162 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  39.26 
 
 		 180 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.68 
 
 		 179 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 163 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  44.25 
 
 		 179 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4236  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.68 
 
 		 132 aa  95.5  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114859  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 		 162 aa  95.1  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3347  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.1 
 
 		 131 aa  95.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.715886  normal  0.525186 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3615  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.1 
 
 		 211 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 		 162 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  35.04 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  45.95 
 
 		 176 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3248  NADH dehydrogenase subunit I  35.21 
 
 		 165 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  40.46 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  38.69 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0994  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 163 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  31.01 
 
 		 161 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0957  NADH dehydrogenase subunit I  32.08 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0765322  normal  0.470027 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  35.51 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  38.4 
 
 		 169 aa  94  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  39.53 
 
 		 164 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  41.09 
 
 		 184 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1432  NADH dehydrogenase subunit I  32.28 
 
 		 165 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  37.41 
 
 		 180 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2051  NADH dehydrogenase subunit I  34.31 
 
 		 162 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100158  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  37.32 
 
 		 180 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3130  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.3 
 
 		 135 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1629  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2265  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2241  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.8  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1036  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160572  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  35.44 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2158  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394971  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2279  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  40.31 
 
 		 176 aa  92  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  45.05 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  45.05 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  45.05 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  45.05 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  45.05 
 
 		 180 aa  92  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0189  NADH dehydrogenase subunit I  35.19 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5569  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3206  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00643522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1069  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 162 aa  91.7  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.74272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2001  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0496982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1351  NADH dehydrogenase subunit I  33.8 
 
 		 162 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0309776  hitchhiker  0.0086006 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  43.36 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.62 
 
 		 199 aa  91.7  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  43.36 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  43.36 
 
 		 180 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.84 
 
 		 170 aa  91.7  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.32 
 
 		 170 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0786  NADH dehydrogenase subunit I  35.77 
 
 		 163 aa  91.3  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.079686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0729  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 180 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1298  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 180 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  44.14 
 
 		 180 aa  91.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1307  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1138  NADH dehydrogenase subunit I  33.1 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>