More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0849 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  100 
 
 		 144 aa  282  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  74.26 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  72.26 
 
 		 144 aa  206  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  72.99 
 
 		 144 aa  204  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  71.53 
 
 		 144 aa  204  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  70.8 
 
 		 139 aa  203  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  70.07 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  69.57 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  71.32 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 141 aa  201  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  71.43 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  68.84 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  69.29 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  69.34 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  68.61 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1154  50S ribosomal protein L16  70.45 
 
 		 139 aa  196  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000032781  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 144 aa  194  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 144 aa  194  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3155  50S ribosomal protein L16  65 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.647303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  67.39 
 
 		 138 aa  194  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  65.69 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  66.43 
 
 		 145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  69.85 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  193  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 139 aa  193  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  68.89 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5780  ribosomal protein L16  68.66 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.742745  normal  0.418872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 137 aa  189  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1671  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 137 aa  189  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0460624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05750  50S ribosomal protein L16  66.67 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748802  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2973  50S ribosomal protein L16  70.15 
 
 		 138 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2681  50S ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  63.43 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  67.15 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  62.77 
 
 		 144 aa  187  2.9999999999999997e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1437  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  normal  0.0931041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1339  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.136974  normal  0.10882 
 
 
-
 
NC_004310  BR1226  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  60.58 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1189  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  63.19 
 
 		 151 aa  187  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  186  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1847  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.015989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0993  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  62.94 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  67.91 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1963  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0673  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000002435  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0705  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000113976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2900  ribosomal protein L16  67.16 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  62.04 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  65.03 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3660  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0256  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 137 aa  184  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3136  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  183  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0302  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00320104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  63.5 
 
 		 144 aa  183  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 179 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  64.23 
 
 		 144 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 139 aa  182  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0346  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1621  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339753  normal  0.316448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  62.32 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  65.03 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0428  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0983834  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1915  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  62.5 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1940  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2025  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.755365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4350  50S ribosomal protein L16  63.38 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215077  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3177  50S ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.943989 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>