220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0596 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0596  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  100 
 
 		 500 aa  1006    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.461448  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1380  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  47.28 
 
 		 493 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.698571 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.84 
 
 		 484 aa  385  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0972  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.49 
 
 		 472 aa  335  7.999999999999999e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.493614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1882  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.75 
 
 		 474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.379133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1042  thiamine biosynthesis protein ThiI  42.2 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000396769 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1094  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.91 
 
 		 484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3250  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3108  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3070  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.66 
 
 		 483 aa  302  7.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0507  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.54 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.667098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3082  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.97 
 
 		 482 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.884917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0455  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.75 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0345  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.75 
 
 		 482 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00371  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.75 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00375  hypothetical protein  36.75 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0466  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.97 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0495  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.75 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01178  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.23 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3210  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.54 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000778782 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0485  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.83 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0464  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.83 
 
 		 482 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3186  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.32 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.304423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0527  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.83 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0472  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.83 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1081  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.54 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2806  thiamine biosynthesis protein  41.96 
 
 		 502 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0459  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.32 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1312  thiamine biosynthesis protein ThiI  41.86 
 
 		 475 aa  292  9e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00281014  normal  0.313151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1033  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.02 
 
 		 482 aa  292  9e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3278  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.63 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2891  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.34 
 
 		 482 aa  289  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0890  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.56 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.49206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2986  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.96 
 
 		 484 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.704653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0938  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.32 
 
 		 482 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3473  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.47 
 
 		 484 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0256811  hitchhiker  0.000477485 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004253  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.82 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000609097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2766  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.33 
 
 		 485 aa  280  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2227  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.97 
 
 		 484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0860245  normal  0.512375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3324  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.4 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.146842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1280  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.39 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2785  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.18 
 
 		 484 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4139  thiamine biosynthesis protein ThiI  36 
 
 		 484 aa  273  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2431  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.67 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2726  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.75 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00293542  normal  0.227571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67580  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5851  thiamine biosynthesis protein ThiI  36.9 
 
 		 484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2799  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.92946  normal  0.155971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3649  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.65 
 
 		 484 aa  269  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2896  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0805298  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1387  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2998  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.174595  hitchhiker  0.000000707392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0902  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.83 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1362  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.412717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1348  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1531  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.54 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5097  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.5 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1308  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  42.06 
 
 		 371 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.06 
 
 		 478 aa  261  1e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5045  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.3 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0419  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.5 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.895602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4919  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.3 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45840  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.95 
 
 		 484 aa  260  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0417  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.66 
 
 		 515 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000383743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0503  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.97 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000447545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0014  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  36.86 
 
 		 416 aa  257  4e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.735237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4816  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.32 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0360  thiamin biosynthesis protein ThiI  34.32 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0346  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.88 
 
 		 484 aa  256  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2566  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.2 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.813354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.69 
 
 		 483 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2118  thiamine biosynthesis protein ThiI  40.21 
 
 		 496 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  36.81 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2024  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.64 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0367  hypothetical protein  35.99 
 
 		 404 aa  196  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0070  thiamine biosynthesis protein  33.59 
 
 		 387 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.090437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0198  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.6 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  37.97 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0796  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.39 
 
 		 406 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1546  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.42 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0599  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.61 
 
 		 383 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27457  normal  0.481972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0224  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.79 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2718  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.02 
 
 		 401 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2184  thiamine biosynthesis protein  33.7 
 
 		 369 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.72421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1319  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.79 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0721  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.6 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.9 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1671  thiamine biosynthesis protein  36.8 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf098  thiamine biosynthesis protein ThiI  32.18 
 
 		 381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000238711  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  32.12 
 
 		 361 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2758  thiamine biosynthesis protein ThiI  37.05 
 
 		 400 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0785401  normal  0.423621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  33.82 
 
 		 370 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1262  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.9 
 
 		 400 aa  173  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.56541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26980  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.23 
 
 		 393 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.121036  normal  0.93751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  35.01 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4784  thiamine biosynthesis protein ThiI  34.03 
 
 		 404 aa  171  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4391  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.77 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4765  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.77 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4545  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.77 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4899  thiamine biosynthesis protein ThiI  33.77 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>