75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0748 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  74.18 
 
 
269 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50.66 
 
 
220 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  51.32 
 
 
226 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  49.65 
 
 
246 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.78 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.2 
 
 
251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.2 
 
 
251 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  51.06 
 
 
126 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  50.56 
 
 
130 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  52.38 
 
 
126 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  36.6 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  50.67 
 
 
148 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  36.67 
 
 
182 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.44 
 
 
181 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  49.33 
 
 
157 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  49.33 
 
 
151 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  42.7 
 
 
93 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  49.33 
 
 
154 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  49.33 
 
 
156 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  44.44 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  44.44 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  36.84 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.44 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  49.33 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  41.74 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  39.1 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.59 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.74 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.41 
 
 
183 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  33.33 
 
 
343 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.23 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.82 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.88 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.55 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.78 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5534  hypothetical protein  34.15 
 
 
193 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.75 
 
 
365 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.9 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.16 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42 
 
 
354 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.14 
 
 
263 aa  48.9  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.37 
 
 
151 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  23.87 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.31 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.72 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.21 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.26 
 
 
143 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.1 
 
 
282 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  50 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.66 
 
 
165 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  27.34 
 
 
274 aa  45.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  21.8 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  31.75 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.84 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.22 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.74 
 
 
151 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3712  hypothetical protein  32.05 
 
 
113 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750791  hitchhiker  0.0000649397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 
397 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.67 
 
 
126 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.3 
 
 
146 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.89 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  37.04 
 
 
135 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>