More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0360 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  66.97 
 
 
663 aa  810  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  67.28 
 
 
668 aa  833  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  67.63 
 
 
670 aa  830  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
659 aa  1298  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  67.53 
 
 
667 aa  841  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  57.7 
 
 
655 aa  659  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  66.77 
 
 
667 aa  827  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  65.36 
 
 
660 aa  849  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  67.73 
 
 
669 aa  812  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  63.69 
 
 
660 aa  843  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  92.87 
 
 
674 aa  1222  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  76.22 
 
 
659 aa  969  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  67.28 
 
 
668 aa  833  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  58.51 
 
 
661 aa  703  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  57.69 
 
 
656 aa  699  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  60.03 
 
 
665 aa  689  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  59.01 
 
 
664 aa  695  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  67.23 
 
 
666 aa  828  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  67.59 
 
 
663 aa  808  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  59.79 
 
 
661 aa  688  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.73 
 
 
669 aa  812  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.73 
 
 
669 aa  820  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.73 
 
 
669 aa  812  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  58.47 
 
 
680 aa  697  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  60.66 
 
 
661 aa  664  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  67.28 
 
 
668 aa  833  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  76.52 
 
 
659 aa  969  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  58.37 
 
 
661 aa  674  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  58.14 
 
 
652 aa  707  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  59.29 
 
 
661 aa  655  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.73 
 
 
669 aa  812  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  67.73 
 
 
669 aa  812  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  67.94 
 
 
670 aa  834  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  75.91 
 
 
659 aa  949  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  67.94 
 
 
678 aa  837  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  67.58 
 
 
668 aa  836  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  59.6 
 
 
661 aa  633  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  53.57 
 
 
658 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  51.18 
 
 
661 aa  572  1e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  51.18 
 
 
661 aa  572  1e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.42 
 
 
662 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  41.17 
 
 
654 aa  460  1e-128  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.57 
 
 
654 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  41.11 
 
 
666 aa  452  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  39.7 
 
 
650 aa  438  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  40.15 
 
 
648 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 
657 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  40.3 
 
 
648 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.72 
 
 
655 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.75 
 
 
648 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  40.15 
 
 
648 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  40.99 
 
 
648 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  40.96 
 
 
648 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.88 
 
 
649 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  40.48 
 
 
649 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  40.96 
 
 
648 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  40.15 
 
 
648 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  40 
 
 
649 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  39.37 
 
 
649 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.31 
 
 
648 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 
653 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  36.35 
 
 
720 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.54 
 
 
570 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.83 
 
 
658 aa  339  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  36.32 
 
 
572 aa  338  1e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.2 
 
 
574 aa  337  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.68 
 
 
697 aa  334  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  37.52 
 
 
583 aa  333  9e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  34.74 
 
 
672 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 
775 aa  329  9e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.92 
 
 
664 aa  323  7e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.69 
 
 
670 aa  321  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
762 aa  320  4e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  38.43 
 
 
568 aa  317  5e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11843  predicted protein  37.86 
 
 
533 aa  315  2e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.34 
 
 
579 aa  311  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 
666 aa  312  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
674 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 
665 aa  305  1e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.11 
 
 
665 aa  305  2e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  38.45 
 
 
594 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  35.45 
 
 
629 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0146  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  36.52 
 
 
568 aa  298  3e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  37.35 
 
 
591 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  38.84 
 
 
583 aa  297  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.07 
 
 
578 aa  297  4e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 
666 aa  296  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.19 
 
 
693 aa  296  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
773 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.55 
 
 
671 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  31.31 
 
 
741 aa  295  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.45 
 
 
682 aa  294  4e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  34.14 
 
 
771 aa  293  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0095  TrkA-N  34.93 
 
 
569 aa  291  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
652 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
666 aa  290  6e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.11 
 
 
636 aa  290  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
666 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.82 
 
 
539 aa  288  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  5.29307e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 
590 aa  284  3e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>