More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4138 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
624 aa  1297  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  88.12 
 
 
679 aa  1139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  48.04 
 
 
616 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  61.11 
 
 
374 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  55.65 
 
 
377 aa  358  2e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  53.93 
 
 
359 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  53.26 
 
 
359 aa  349  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  50.56 
 
 
357 aa  338  2e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  37.08 
 
 
1162 aa  149  1e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  39.01 
 
 
2401 aa  144  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
785 aa  142  1e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
1739 aa  142  2e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
1077 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
1523 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  32.31 
 
 
1219 aa  137  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
1523 aa  136  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
1267 aa  136  1e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
369 aa  135  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
880 aa  133  1e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
1340 aa  133  1e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
303 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
632 aa  129  1e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
300 aa  128  4e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
525 aa  128  4e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
293 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
824 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
958 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
298 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
1359 aa  124  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
337 aa  123  1e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  34.25 
 
 
320 aa  122  2e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.35 
 
 
1119 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
662 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
703 aa  121  4e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 
610 aa  120  5e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
340 aa  120  5e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
289 aa  121  5e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
635 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
313 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
902 aa  120  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
994 aa  119  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
1268 aa  119  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
725 aa  119  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.8 
 
 
700 aa  119  2e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
1435 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
310 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
294 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
1267 aa  117  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 
714 aa  117  7e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
311 aa  117  8e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
733 aa  117  9e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  30.22 
 
 
632 aa  116  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
312 aa  115  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
1759 aa  115  2e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
602 aa  114  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
1509 aa  113  1e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
652 aa  112  2e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
705 aa  112  2e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
551 aa  112  2e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
298 aa  112  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
457 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
709 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
709 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  27.83 
 
 
860 aa  111  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
683 aa  111  4e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
3301 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
625 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.17 
 
 
1644 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
625 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
671 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.17 
 
 
1644 aa  110  7e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
401 aa  110  8e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
625 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
996 aa  109  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
717 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
430 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
1275 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
783 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
988 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
314 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
670 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
1334 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  30.82 
 
 
376 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
360 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
551 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
324 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  28.32 
 
 
810 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
555 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
302 aa  108  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
717 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  26.39 
 
 
1232 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
790 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.33 
 
 
283 aa  107  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  29.76 
 
 
1837 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
1312 aa  107  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
729 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
319 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  27.8 
 
 
731 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1188 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.73 
 
 
652 aa  106  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>