More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1708 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  45.35 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  43.85 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  42.47 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  43.3 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  42.47 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  42.37 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  43.08 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  42.31 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  42.69 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  41.7 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  42.31 
 
 		 274 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  38.22 
 
 		 308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  43.55 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  41.25 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  41.25 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  41.54 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  41.92 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  41.26 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  41.54 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  40.84 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  41.6 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  38.22 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  41.83 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  37.45 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  37.45 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  39.46 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  37.59 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  37.96 
 
 		 268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  37.08 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  40.17 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  40.15 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  39 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  37.32 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  37.59 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  37.31 
 
 		 270 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  37.69 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  37.69 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  37.69 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  34.52 
 
 		 283 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  34.07 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  38.58 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  35.36 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2358  transposase, IS4 family protein  40.64 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.501674  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  35.74 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  36.4 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  36.59 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  35.63 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  35.63 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  35.63 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  34.03 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  34.03 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  34.03 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  34.03 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>