More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0139 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
319 aa  659  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
303 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
300 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
298 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  31.67 
 
 
320 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
302 aa  145  8e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  30 
 
 
342 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
321 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
314 aa  140  2e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
305 aa  135  7e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
305 aa  135  1e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  31.77 
 
 
346 aa  133  4e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
722 aa  128  1e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.21 
 
 
283 aa  127  2e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 
311 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 
293 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
616 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
306 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.03 
 
 
284 aa  122  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
313 aa  121  1e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
311 aa  121  1e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1643  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 
324 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
679 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
288 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
624 aa  120  5e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
327 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
298 aa  119  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
279 aa  118  1e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
841 aa  117  2e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
489 aa  117  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
299 aa  117  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.97 
 
 
291 aa  116  4e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2583  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
330 aa  115  7e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
282 aa  115  9e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
331 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
334 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
303 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
1267 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 
344 aa  112  7e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  4.44925e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0584  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
347 aa  112  8e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0121583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
318 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
286 aa  112  1e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  35.35 
 
 
318 aa  112  1e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.39 
 
 
342 aa  112  1e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
297 aa  110  2e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
836 aa  111  2e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
330 aa  110  2e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
1267 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
324 aa  110  4e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
841 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
300 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
327 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.97 
 
 
838 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
822 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
290 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  30.54 
 
 
339 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
330 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  30.96 
 
 
339 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
327 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
455 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
294 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
315 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
315 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
359 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
324 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1725  putative rhamnosyltransferase  26.3 
 
 
311 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0378366  normal  0.370128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  22.91 
 
 
342 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
334 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
310 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
322 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
332 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
337 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
306 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
308 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  30.27 
 
 
320 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
337 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.93 
 
 
355 aa  102  9e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 
318 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
291 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  26.1 
 
 
358 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
299 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
353 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
318 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
329 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
337 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
313 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  29.67 
 
 
318 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
325 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.58134e-07  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
355 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
311 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
308 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
314 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
346 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  1.0329e-13 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
297 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
305 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
340 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
401 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>