More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0135 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  89.86 
 
 
724 aa  1222    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
723 aa  1425    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  58.5 
 
 
639 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 
783 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  47.29 
 
 
640 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
712 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
712 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 
712 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  44.68 
 
 
675 aa  521  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
677 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.94 
 
 
850 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0522  heavy metal translocating P-type ATPase  46.59 
 
 
778 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
635 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  44.73 
 
 
707 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
641 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  42.07 
 
 
641 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
641 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  41.5 
 
 
641 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  41.5 
 
 
641 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  41.65 
 
 
641 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  41.5 
 
 
641 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  41.29 
 
 
641 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  41.63 
 
 
641 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  41.63 
 
 
641 aa  482  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  41.65 
 
 
641 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  41.29 
 
 
641 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
713 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.12 
 
 
709 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 
873 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
647 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
809 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.55 
 
 
767 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2806  heavy metal translocating P-type ATPase  44.11 
 
 
806 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 
880 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
637 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  42.7 
 
 
835 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.81 
 
 
870 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  44.09 
 
 
735 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  43.3 
 
 
835 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  42.81 
 
 
852 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
869 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
830 aa  457  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
851 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 
737 aa  459  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
673 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  42.97 
 
 
851 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
834 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  41.29 
 
 
738 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
833 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 
826 aa  452  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  42.77 
 
 
833 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
861 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  43.67 
 
 
750 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  41 
 
 
822 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2137  heavy metal translocating P-type ATPase  43.25 
 
 
853 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2293  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
853 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
851 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.23 
 
 
751 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.61 
 
 
825 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
640 aa  441  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000621697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
665 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
785 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3485  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 
740 aa  435  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.333666  normal  0.66884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
812 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
665 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1753  heavy metal translocating P-type ATPase  40.26 
 
 
829 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5970  cation efflux ATPase CzcP  40.26 
 
 
829 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0427741  normal  0.0148947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
665 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 
665 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  42.28 
 
 
842 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
739 aa  429  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.28 
 
 
1022 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  42.58 
 
 
656 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
868 aa  427  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3184  hypothetical protein  45.76 
 
 
636 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
681 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  39.76 
 
 
926 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.34 
 
 
656 aa  423  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  40.12 
 
 
651 aa  423  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  45.37 
 
 
665 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.381372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  43.57 
 
 
656 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 
654 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
939 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.8 
 
 
734 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2207  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
656 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
655 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 
800 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
718 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
655 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 
651 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  42.38 
 
 
655 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 
800 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3297  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 
646 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00745206  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  38.22 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  41.44 
 
 
712 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 
709 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 
652 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 
652 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.69 
 
 
655 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>