More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2207 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3097  heavy metal translocating P-type ATPase  66.87 
 
 
670 aa  755    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0656722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  75.63 
 
 
655 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  73.85 
 
 
652 aa  861    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  76.71 
 
 
655 aa  922    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5318  heavy metal translocating P-type ATPase  62.94 
 
 
710 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.449789 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  60.52 
 
 
712 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  87.02 
 
 
656 aa  1056    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  75.53 
 
 
656 aa  871    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0776  heavy metal translocating P-type ATPase  58.11 
 
 
630 aa  642    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634796  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  74.96 
 
 
654 aa  886    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
723 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.724318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1792  heavy metal translocating P-type ATPase  64.69 
 
 
722 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0266735  normal  0.635551 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  74.53 
 
 
652 aa  866    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2831  heavy metal translocating P-type ATPase  61.31 
 
 
705 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12024  metal cation transporter P-type ATPase G ctpG  69.48 
 
 
771 aa  763    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.350952  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  67.59 
 
 
651 aa  824    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4476  heavy metal translocating P-type ATPase  69.17 
 
 
650 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  69.17 
 
 
650 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.823072  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4207  heavy metal translocating P-type ATPase  69.17 
 
 
650 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  75.63 
 
 
655 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  73.73 
 
 
651 aa  886    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2207  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
656 aa  1256    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5693  heavy metal translocating P-type ATPase  62.94 
 
 
710 aa  693    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416286 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  76.86 
 
 
655 aa  904    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1493  heavy metal translocating P-type ATPase  62.77 
 
 
723 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122984  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0505  heavy metal translocating P-type ATPase  70.5 
 
 
660 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  76.53 
 
 
655 aa  907    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  76.3 
 
 
656 aa  934    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3681  heavy metal translocating P-type ATPase  62.78 
 
 
710 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5411  heavy metal translocating P-type ATPase  70.5 
 
 
660 aa  772    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.043648 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5391  heavy metal translocating P-type ATPase  70.5 
 
 
660 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22910  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  56.51 
 
 
637 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  56.18 
 
 
679 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11850  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  56.06 
 
 
678 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
635 aa  450  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 
707 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  39.52 
 
 
783 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 
712 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.44 
 
 
712 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
712 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
767 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
637 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
723 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5337  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
851 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5375  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
869 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.61 
 
 
737 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2822  heavy metal translocating P-type ATPase  42.36 
 
 
870 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5674  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
851 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.64 
 
 
709 aa  405  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3700  heavy metal translocating P-type ATPase  42.16 
 
 
852 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143206  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
738 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  39.91 
 
 
873 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  42.39 
 
 
751 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
677 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
835 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.12 
 
 
750 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  37.2 
 
 
641 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  37.2 
 
 
641 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  37.04 
 
 
641 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
641 aa  389  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  37.04 
 
 
641 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
822 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  37.04 
 
 
641 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.29 
 
 
673 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
713 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  36.83 
 
 
641 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
833 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  37.04 
 
 
641 aa  385  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  37.04 
 
 
641 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.3 
 
 
641 aa  385  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
738 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  38.68 
 
 
735 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  42.31 
 
 
904 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
850 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  42.88 
 
 
793 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
825 aa  380  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.75 
 
 
785 aa  381  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  39 
 
 
809 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.46 
 
 
718 aa  378  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
1022 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0463  heavy metal translocating P-type ATPase  41.9 
 
 
724 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  39.45 
 
 
728 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.15 
 
 
726 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3706  cadmium-translocating P-type ATPase  38.08 
 
 
675 aa  374  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3018  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
639 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000244984  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  39.45 
 
 
728 aa  375  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  41.92 
 
 
709 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  37.58 
 
 
868 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  37.04 
 
 
641 aa  372  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  37.84 
 
 
826 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
835 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2582  heavy metal translocating P-type ATPase  38.45 
 
 
830 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.787057  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 
812 aa  372  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 
851 aa  372  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  39 
 
 
773 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  40.63 
 
 
753 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
984 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
984 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  43.36 
 
 
722 aa  369  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 
880 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>