More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0618 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0618  bifunctional: precorrin-3 methyltransferase/precorrin-6X reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 519 aa  1044    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.157389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2355  precorrin-3B C17-methyltransferase  57.2 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0146728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2086  precorrin-3B C(17)-methyltransferase  44.13 
 
 		 287 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1275  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.67 
 
 		 244 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.158636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  43.21 
 
 		 867 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1378  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.34 
 
 		 242 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3628  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.77 
 
 		 623 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1296  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.28 
 
 		 240 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2485  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.28 
 
 		 623 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0379  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.27 
 
 		 631 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1675  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.44 
 
 		 629 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0643  precorrin-3 methyltransferase  45.04 
 
 		 561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0184568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4366  precorrin-3 methyltransferase  41.63 
 
 		 663 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.216409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1300  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.26 
 
 		 253 aa  190  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0315  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.42 
 
 		 243 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2767  precorrin-3 methyltransferase / precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating)  38.87 
 
 		 331 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545278  normal  0.0717753 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0482  precorrin-3 C-17 methylase  40.4 
 
 		 329 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0447  precorrin-3 C-17 methylase  40.4 
 
 		 329 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1549  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2616  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.24 
 
 		 596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3128  precorrin-3 methyltransferase  38.46 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6033  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.08 
 
 		 810 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1752  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.69 
 
 		 264 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2293  precorrin-3B C17-methyltransferase/conserved domain-containing protein  39.44 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.671445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0216  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.93 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2153  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.84 
 
 		 331 aa  180  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918885 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1685  precorrin-3 methyltransferase  38.46 
 
 		 326 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1014  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.76 
 
 		 327 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  37.28 
 
 		 772 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0935  precorrin-3 methyltransferase  39.15 
 
 		 238 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0243766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  39.71 
 
 		 777 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1301  precorrin-6x reductase  41.81 
 
 		 261 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1015  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.5 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1428  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.66 
 
 		 240 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0114869  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0623  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.55 
 
 		 240 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0224111  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2149  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.66 
 
 		 241 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.482473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  39.68 
 
 		 776 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1234  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.66 
 
 		 240 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0777573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.51 
 
 		 797 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2249  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.24 
 
 		 241 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.209455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2362  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.24 
 
 		 241 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.860071  normal  0.738043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1374  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.68 
 
 		 258 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2203  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.24 
 
 		 241 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2196  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.24 
 
 		 241 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  37.76 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.38 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1344  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.96 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.74 
 
 		 778 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2536  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.98 
 
 		 242 aa  168  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3744  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.25 
 
 		 328 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1714  precorrin-3 methyltransferase  36.67 
 
 		 241 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0830  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.34 
 
 		 251 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0437244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0077  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.25 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2636  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.11 
 
 		 612 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4874  CbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38 
 
 		 567 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  43.09 
 
 		 837 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.647433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  40 
 
 		 250 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0236  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.03 
 
 		 249 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.717324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1869  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.55 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.186861  normal  0.466196 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.17 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2709  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.85 
 
 		 236 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.424335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  40.83 
 
 		 787 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4032  cobalt-precorrin-6x reductase  35.51 
 
 		 258 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2356  precorrin-3 methyltransferase  38.15 
 
 		 267 aa  160  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0433914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4414  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.65 
 
 		 567 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_004310  BR1289  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2500  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.19 
 
 		 263 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1252  cbiG protein/precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 		 564 aa  159  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0680839  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4826  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.2 
 
 		 565 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1702  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.84 
 
 		 250 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.51 
 
 		 451 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4070  cobalt-precorrin-6x reductase  35.1 
 
 		 258 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2863  precorrin-3 methyltransferase  37.75 
 
 		 574 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3146  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.58 
 
 		 572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  42.28 
 
 		 800 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0760  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.1 
 
 		 250 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.920637  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0118  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.89 
 
 		 250 aa  156  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0629  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.55 
 
 		 266 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1589  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.35 
 
 		 577 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76858  normal  0.647382 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0200  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.29 
 
 		 250 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1571  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.75 
 
 		 595 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53726  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23501  bifunctional cbiH protein and precorrin-3B C17-methyltransferase  38.68 
 
 		 594 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0124  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.74 
 
 		 481 aa  155  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1997  precorrin-3B C17-methyltransferase region  39.51 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3181  precorrin-3 methyltransferase  41.42 
 
 		 655 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1525  precorrin-3B C17-methyltransferase  39.11 
 
 		 245 aa  155  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00108788 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3473  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.15 
 
 		 331 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2824  precorrin-3 methyltransferase  40.96 
 
 		 244 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1242  precorrin-3 methyltransferase  37.2 
 
 		 604 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.38212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4574  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  40.16 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4704  precorrin-3B C17-methyltransferase  36.55 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5372  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.8 
 
 		 567 aa  154  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224652  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1191  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.55 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168575  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1671  precorrin-3B C17-methyltransferase  38.55 
 
 		 569 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843717  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1471  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.56 
 
 		 244 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.56995  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4616  precorrin-3B C17-methyltransferase  37.45 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.542511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4882  precorrin-3B C17-methyltransferase  35.74 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2989  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating) / precorrin-3 methyltransferase  37.85 
 
 		 258 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1521  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.96 
 
 		 244 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  0.0426872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1719  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.13 
 
 		 265 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>