More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1789 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  86.01 
 
 		 434 aa  736    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  85.78 
 
 		 434 aa  731    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  64.27 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  67.63 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  57.11 
 
 		 438 aa  474  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  55.61 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  60.19 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  60 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  56.48 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  56.48 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  56.48 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  57.75 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  55.92 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  55.5 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  56.6 
 
 		 429 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  56.73 
 
 		 723 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  58.95 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  51.98 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  54.46 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  50.71 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  54.88 
 
 		 408 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  49.77 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  54.87 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  55.13 
 
 		 428 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  53.57 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  53.73 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  54.05 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  50.11 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  53.92 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  53.83 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  52.78 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  53.21 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  53.01 
 
 		 420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  54.25 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  53.69 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  52 
 
 		 425 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  55.04 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  56.82 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  53.55 
 
 		 422 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  53.57 
 
 		 412 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  56.24 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  55.88 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  55.88 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  52.03 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  52.38 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  53.9 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  52.61 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  54.39 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  54.68 
 
 		 411 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  54.8 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  57.07 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  49.31 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  54.92 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  53.86 
 
 		 426 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  50.97 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  55.97 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  50.83 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  56.03 
 
 		 408 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  57.47 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  55.74 
 
 		 408 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  50.6 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  52.86 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  50.48 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  51.33 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  54.23 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  47.09 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  52.9 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  45.96 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  52.13 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  49.28 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  46.6 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  44.1 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  48.01 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  43.88 
 
 		 395 aa  356  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  45.86 
 
 		 388 aa  355  7.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  41.8 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  39.29 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  35.83 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  35.71 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  36.04 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  36.24 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  34.47 
 
 		 442 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  38.05 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  35.76 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.63 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  35.01 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  33.99 
 
 		 446 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  35.19 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  34.99 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.2 
 
 		 416 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  37.87 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  33.85 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  32.26 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  29.23 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 384 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  34.86 
 
 		 444 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  34.71 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  34.71 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>