267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3353 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  78.77 
 
 		 179 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  77.36 
 
 		 180 aa  257  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  59.88 
 
 		 170 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  64.71 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  58.08 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  59.64 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  49.1 
 
 		 169 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  52.98 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  46.07 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  52.44 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1729  dihydrofolate reductase  45.88 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000733059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 167 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 		 167 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  45.29 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.73 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 163 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1090  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  49.7 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 170 aa  150  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  46.24 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.5 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  44.19 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3387  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  44.38 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  46.06 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2811  Dihydrofolate reductase  45.56 
 
 		 292 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000627481  hitchhiker  0.0000305943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 167 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  46.1 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  44.05 
 
 		 195 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  44.58 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.83 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 160 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 209 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  44.12 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  45.06 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0603  Dihydrofolate reductase  48.1 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.052544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  45.7 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 163 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2360  dihydrofolate reductase  46.67 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.138466 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  39.66 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3262  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  40.48 
 
 		 160 aa  134  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3786  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 		 162 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.1214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 		 195 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  39.29 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  42.42 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  39.76 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2312  dihydrofolate reductase  48.98 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312727  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  39.75 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  44.37 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  41.86 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  40.24 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  39.16 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  41.57 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>