189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0871 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 314 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  94.59 
 
 		 314 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  86.94 
 
 		 314 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  81.85 
 
 		 315 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  84.71 
 
 		 315 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  78.03 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  77.39 
 
 		 344 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 315 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  47.28 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  44.3 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  46.56 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  48.08 
 
 		 333 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  45.78 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  44.59 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  44.69 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  44.69 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  45.25 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  42.63 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  42.77 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  41.18 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  39.56 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  37.29 
 
 		 329 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  35.56 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 		 327 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  35.14 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  31.42 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  32.99 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  31.08 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  33.77 
 
 		 345 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  34.21 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.77 
 
 		 345 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  32.46 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  32.04 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  30.45 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  32.06 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 329 aa  116  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  28.37 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  32.97 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  32.97 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  32.97 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  32.97 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  31.44 
 
 		 331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  32.53 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  28.23 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  32.12 
 
 		 331 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  32.12 
 
 		 337 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  32.62 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  29.97 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  32.87 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  32.86 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  26.26 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  31.48 
 
 		 638 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  26.12 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  27.31 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  29.32 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.23 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  34 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  32.64 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  26.16 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  28.21 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>