45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0789 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  83.4 
 
 		 259 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  68.85 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  63.16 
 
 		 254 aa  329  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  62 
 
 		 253 aa  325  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  55.38 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  53.94 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  31.72 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  32.78 
 
 		 327 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  32.13 
 
 		 328 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  34.11 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  32.96 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  34.83 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  32.67 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  31.63 
 
 		 318 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  35.64 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.63 
 
 		 329 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.03 
 
 		 327 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  28.84 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.94 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  30.88 
 
 		 379 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  29.91 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  30 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  32.32 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  32.32 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  31.76 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  31.61 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  31.56 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  30.33 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  31.11 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  29.61 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  26.05 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  32.58 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  28.05 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  29.37 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  30.7 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.24 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  28.87 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.21 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.03 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  30.2 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  26.21 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  30.17 
 
 		 182 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  27.04 
 
 		 202 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>