More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0069 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
255 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  93.73 
 
 
255 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  87.4 
 
 
255 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.9 
 
 
255 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  71.76 
 
 
255 aa  399  1e-110  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  72.16 
 
 
255 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  74.12 
 
 
255 aa  390  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.6 
 
 
256 aa  283  2e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.15 
 
 
282 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.52 
 
 
256 aa  269  3e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.59 
 
 
256 aa  266  3e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.78 
 
 
256 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  47.43 
 
 
256 aa  253  2e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.2 
 
 
256 aa  252  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.4 
 
 
255 aa  252  4e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  47.6 
 
 
256 aa  251  9e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  47.04 
 
 
255 aa  249  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  50.41 
 
 
256 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.8 
 
 
256 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.39 
 
 
259 aa  248  6e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
255 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  50 
 
 
255 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.21 
 
 
278 aa  242  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  45.67 
 
 
255 aa  241  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 
255 aa  240  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.8 
 
 
256 aa  240  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.43 
 
 
259 aa  239  3e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  47.77 
 
 
262 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.03 
 
 
259 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.08 
 
 
258 aa  234  1e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.46 
 
 
254 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.81 
 
 
256 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.54 
 
 
257 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.54 
 
 
260 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.81 
 
 
256 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 
271 aa  225  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.54 
 
 
260 aa  221  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  46.26 
 
 
227 aa  218  5e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.31 
 
 
248 aa  214  1e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.05 
 
 
242 aa  213  2e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
272 aa  213  3e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 
242 aa  213  3e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 
257 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.58 
 
 
263 aa  200  2e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1432  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.77 
 
 
259 aa  199  4e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.949505  normal  0.289854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.49 
 
 
258 aa  197  1e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  3.96006e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 
257 aa  196  2e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
258 aa  196  4e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.5 
 
 
248 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.58 
 
 
258 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
254 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
257 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.45 
 
 
257 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.88 
 
 
258 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1038  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.62 
 
 
259 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.769751 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  43.25 
 
 
252 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
257 aa  189  3e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.26 
 
 
266 aa  189  3e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  43.08 
 
 
252 aa  188  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  40.52 
 
 
265 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.18 
 
 
246 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.86 
 
 
259 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
252 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.09 
 
 
259 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.41 
 
 
257 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.67 
 
 
258 aa  184  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.09 
 
 
259 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.5 
 
 
252 aa  184  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  42.19 
 
 
259 aa  184  1e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.47 
 
 
259 aa  184  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.27 
 
 
258 aa  184  1e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  42.97 
 
 
263 aa  184  1e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.52 
 
 
256 aa  183  2e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.22 
 
 
263 aa  182  5e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.62 
 
 
259 aa  181  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
259 aa  181  8e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.46 
 
 
256 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.34 
 
 
266 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  40.67 
 
 
284 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  38.55 
 
 
257 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.7 
 
 
264 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.73 
 
 
259 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.41 
 
 
257 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.94 
 
 
257 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.41 
 
 
257 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.8 
 
 
263 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
258 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.2 
 
 
255 aa  174  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.2 
 
 
255 aa  174  1e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.98 
 
 
250 aa  174  1e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.94 
 
 
259 aa  174  1e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  40.45 
 
 
266 aa  174  1e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.13 
 
 
268 aa  174  2e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  5.89518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.23 
 
 
245 aa  173  2e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.18 
 
 
269 aa  173  2e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
257 aa  173  2e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.7 
 
 
258 aa  173  2e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.19 
 
 
256 aa  173  2e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.8 
 
 
251 aa  172  3e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.81 
 
 
279 aa  172  3e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>