More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2294 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0969  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.61 
 
 
255 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2294  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II) (GLX II) protein  100 
 
 
255 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.198098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2206  hydroxyacylglutathione hydrolase  83.92 
 
 
255 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1042  hydroxyacylglutathione hydrolase  62.3 
 
 
256 aa  325  3e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  53.36 
 
 
256 aa  281  9e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1578  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.38 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.156565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3813  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.51 
 
 
248 aa  272  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3080  beta-lactamase-like  50.2 
 
 
255 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2381  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.43 
 
 
256 aa  262  4e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.239292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2019  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.41 
 
 
282 aa  260  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.612705  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3270  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.99 
 
 
256 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.09 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1898  hydroxyacylglutathione hydrolase  53.47 
 
 
256 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.76 
 
 
242 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0614  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
255 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0508  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 
255 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11609  normal  0.0226917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0373  beta-lactamase-like protein  45.28 
 
 
255 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.717136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2552  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.22 
 
 
256 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.964384  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0069  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 
255 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0430  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.59 
 
 
256 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0093  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.67 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.117082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1986  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.05 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1663  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.91 
 
 
242 aa  241  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4036  glyoxalase II  46.43 
 
 
256 aa  241  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16683  glyoxalase  44.71 
 
 
262 aa  240  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1936  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.04 
 
 
257 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1863  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
260 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1321  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.49 
 
 
254 aa  232  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2798  hydroxyacylglutathione hydrolase  50.44 
 
 
272 aa  231  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.233678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0923  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.04 
 
 
260 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.319486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0448  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
255 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0466  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.09 
 
 
255 aa  228  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.991116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  45.1 
 
 
256 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7609  putative hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  43.31 
 
 
255 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185313  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2063  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 
255 aa  224  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.136922  hitchhiker  0.00967552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0917  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.87 
 
 
258 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0378  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.24 
 
 
248 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3582  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.03 
 
 
256 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.148531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
257 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3875  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
256 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2438  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.29 
 
 
259 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.7 
 
 
258 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
258 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.72 
 
 
258 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1657  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.75 
 
 
254 aa  204  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
259 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.23 
 
 
259 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
256 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
259 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.73 
 
 
263 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  44.23 
 
 
259 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2510  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.32 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.68 
 
 
257 aa  198  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.83 
 
 
258 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.31 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0684  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.19 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
257 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.02 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2733  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal  0.296553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.69 
 
 
259 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.92 
 
 
259 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
257 aa  192  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  43.75 
 
 
252 aa  191  9e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
257 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  41.7 
 
 
257 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  44.19 
 
 
255 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1778  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.25 
 
 
243 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0392485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.18 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.15 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6889  predicted protein  42.04 
 
 
227 aa  181  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.359449  normal  0.106822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.51 
 
 
259 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.82 
 
 
267 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.08 
 
 
256 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.38 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  36.02 
 
 
257 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.02 
 
 
257 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.25 
 
 
266 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
258 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.25 
 
 
255 aa  175  7e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  36.36 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.4 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  39.48 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1235  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.47 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0229191  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.1 
 
 
263 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.54 
 
 
259 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  40.15 
 
 
250 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.15 
 
 
250 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.23 
 
 
266 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.25 
 
 
251 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.96 
 
 
279 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.33 
 
 
279 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 
240 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.44 
 
 
264 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.5 
 
 
251 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.98 
 
 
250 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.59 
 
 
256 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.33 
 
 
251 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  39.85 
 
 
266 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>