More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2102 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  96.03 
 
 
403 aa  759  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  86.6 
 
 
403 aa  671  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.51581e-09 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  85.61 
 
 
403 aa  685  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  85.86 
 
 
403 aa  641  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  85.86 
 
 
411 aa  643  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  100 
 
 
403 aa  783  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  83.13 
 
 
403 aa  630  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  86.1 
 
 
403 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  81.14 
 
 
403 aa  612  1e-174  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  82.13 
 
 
403 aa  605  1e-172  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  81.39 
 
 
403 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  67.57 
 
 
404 aa  552  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  68.73 
 
 
403 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  67.57 
 
 
404 aa  541  1e-152  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  66.75 
 
 
404 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  62.03 
 
 
406 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  61.27 
 
 
411 aa  466  1e-130  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  61.93 
 
 
417 aa  458  1e-128  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  63.78 
 
 
414 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  58.42 
 
 
423 aa  433  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  50.12 
 
 
424 aa  368  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  51.76 
 
 
412 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 
400 aa  332  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  44.3 
 
 
418 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  43.37 
 
 
403 aa  289  5e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 
421 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  43.3 
 
 
418 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  42.86 
 
 
418 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  41.25 
 
 
416 aa  271  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  41.54 
 
 
433 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
419 aa  262  7e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  41.34 
 
 
439 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  41.09 
 
 
419 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
421 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  36.36 
 
 
467 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  36.36 
 
 
467 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  36.36 
 
 
467 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  36.36 
 
 
467 aa  201  1e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  35.32 
 
 
606 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  34.01 
 
 
455 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  36.51 
 
 
468 aa  182  8e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  36.51 
 
 
468 aa  182  9e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
420 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
455 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 
435 aa  180  5e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 
435 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  31.16 
 
 
417 aa  176  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  36.89 
 
 
406 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  36.61 
 
 
406 aa  174  3e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  36.61 
 
 
406 aa  174  3e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
398 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 
417 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 
397 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  31.35 
 
 
420 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  30.2 
 
 
428 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  29.92 
 
 
418 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  28.79 
 
 
436 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  30.18 
 
 
440 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.71 
 
 
441 aa  164  2e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  32.67 
 
 
389 aa  164  2e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.71 
 
 
422 aa  163  5e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  30.75 
 
 
426 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
390 aa  162  8e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  31.02 
 
 
426 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  31.02 
 
 
426 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
382 aa  161  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  32.79 
 
 
402 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.55 
 
 
389 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  33.52 
 
 
421 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  33.52 
 
 
421 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.55 
 
 
389 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  27.73 
 
 
389 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 
395 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.55 
 
 
389 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  29.59 
 
 
425 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  27.73 
 
 
389 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  33.98 
 
 
418 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
403 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  28.98 
 
 
389 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  29.97 
 
 
912 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  29.7 
 
 
895 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.49 
 
 
387 aa  156  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1925  major facilitator transporter  33.97 
 
 
399 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
398 aa  154  3e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.19 
 
 
422 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  29.53 
 
 
905 aa  153  6e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  36.62 
 
 
394 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  32.37 
 
 
917 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
438 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
438 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  31.73 
 
 
395 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
443 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
428 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  32.34 
 
 
424 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18730  nitrate/nitrite transporter  32.96 
 
 
405 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.781534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>