More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0149 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  98.48 
 
 		 593 aa  1174    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  66.89 
 
 		 595 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  67.51 
 
 		 595 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 593 aa  1190    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  70.44 
 
 		 596 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  88.36 
 
 		 592 aa  1063    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  93.54 
 
 		 588 aa  1070    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  56.11 
 
 		 595 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  55.28 
 
 		 595 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0175  alginate biosynthesis sensor protein KinB  51.6 
 
 		 598 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 612 aa  223  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 444 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 489 aa  213  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 581 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 453 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 604 aa  198  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  31.57 
 
 		 581 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  31.35 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 589 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 458 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.43 
 
 		 537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 621 aa  189  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 610 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 597 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 581 aa  187  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  27.83 
 
 		 762 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 623 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 600 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 621 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 758 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 885 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  31.26 
 
 		 584 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 597 aa  180  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  29.15 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  29.08 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 608 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 592 aa  178  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 584 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 577 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 591 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 611 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 571 aa  174  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 599 aa  174  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.46 
 
 		 591 aa  173  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 597 aa  173  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 604 aa  173  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 645 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  25.86 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  29.55 
 
 		 613 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  25.86 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 556 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 606 aa  171  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 650 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 556 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 608 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  23.99 
 
 		 586 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 619 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 593 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  29.23 
 
 		 613 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 584 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  29.23 
 
 		 613 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1319 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 534 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.67 
 
 		 598 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 546 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 677 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  27.46 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  26.53 
 
 		 571 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 602 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 585 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  29.02 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  29.02 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  29.02 
 
 		 613 aa  164  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  29.02 
 
 		 613 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  26.38 
 
 		 565 aa  163  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 584 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>