More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3023 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  71.01 
 
 		 249 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  61.7 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  47.46 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  51.54 
 
 		 241 aa  230  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3790  hypothetical protein  79.85 
 
 		 147 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.952692  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  49.78 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  47.66 
 
 		 242 aa  211  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  42.56 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  41.56 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  41.22 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  44.49 
 
 		 263 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  40.08 
 
 		 263 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  39.17 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  38.98 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  43.19 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  41.67 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  41.67 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  41.2 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  40.1 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  35.27 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  34.15 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  40.38 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  40.51 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  39.07 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  39.09 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.66 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  34.44 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  33.88 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  34.8 
 
 		 274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  37.09 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  32.23 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  34.92 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  33.47 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  37.95 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  34.16 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  37.21 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  33.75 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  34.41 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  33.75 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  33.75 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  33.6 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  35.43 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  34.73 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  34.4 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  35.68 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  34.02 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  34.65 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  35 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  33.47 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.5 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  32.62 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  33.05 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  33.61 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  31.33 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  30.89 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  33.06 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.47 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  30.47 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  32.1 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  34.03 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  31.75 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  31.67 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  31.8 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  32.61 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  35.87 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  32.64 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  34.67 
 
 		 264 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  30.49 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  30.56 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  34.69 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  29.22 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  32.85 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  32.82 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  32.99 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  32.99 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  29.96 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  29.85 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  32.47 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  31.38 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  32.51 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  32.49 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  34.78 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  34.24 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  31.44 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  30.65 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>