82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1307 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  287  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  96.58 
 
 		 146 aa  278  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  97.22 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  97.22 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  67.12 
 
 		 151 aa  200  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  64.43 
 
 		 150 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  64.12 
 
 		 133 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  54.93 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  52.82 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  52.78 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35200  hypothetical protein  59.22 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  34.86 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  37.96 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  35.96 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  32.2 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  39.53 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  37 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  31.97 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3525  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  37.38 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  28.3 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  33.94 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  31.03 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  35.63 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  39.39 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  36.59 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  33.77 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1681  hypothetical protein  33.78 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.232652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  31.93 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9304  hypothetical protein  34.09 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.030186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  37.1 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2752  hypothetical protein  36 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176431  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0092  hypothetical protein  57.5 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0081  hypothetical protein  57.5 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461887  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0079  hypothetical protein  57.5 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  41.82 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  32.63 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  36.36 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  45.1 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 217 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  43.9 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0811  protein of unknown function DUF1232  53.66 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5607  hypothetical protein  43.9 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000035022  hitchhiker  2.94963e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  30.36 
 
 		 217 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1529  protein of unknown function DUF1232  40.62 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4172  hypothetical protein  52.38 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0445378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001113  hypothetical protein  37.68 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.777907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  48.48 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 217 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  37.84 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  37.84 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4824  DNA-binding protein  31.63 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0158337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04866  hypothetical protein  38.24 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 217 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 217 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0909  protein of unknown function DUF1232  38.64 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  40.3 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  45.45 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1729  hypothetical protein  35.23 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0469574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  28.95 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0411  transcriptional regulator  37.84 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0476  DNA-binding protein  37.84 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0854  hypothetical protein  35.87 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0567626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1805  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2192  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 218 aa  41.2  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.426149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  43.59 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4050  protein of unknown function DUF1232  43.64 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  40.74 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3727  protein of unknown function DUF1232  43.64 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2073  protein of unknown function DUF1232  31.76 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0661  hypothetical protein  53.12 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1882  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  45.24 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>