More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2602 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  100 
 
 		 333 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2805  thiamine-monophosphate kinase  53.05 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.707056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  54.6 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  52.45 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  50.61 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  49.69 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  50.31 
 
 		 323 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0028  thiamine-monophosphate kinase  47.11 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  40.36 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  42.02 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  40.87 
 
 		 341 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  40.49 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  39.09 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  39.57 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  38.83 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  40.85 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  39.8 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  39.58 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  40.13 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  39.63 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  39.51 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  39.76 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  41.59 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  38.62 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  39.88 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  37.87 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  37.46 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  40.96 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  39.34 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  37.12 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04395  thiamine monophosphate kinase  39.29 
 
 		 365 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  38.72 
 
 		 319 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  37.19 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  37.2 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  38.51 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  36.25 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  40 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  39.35 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  36.59 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  37.21 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  38.79 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  36.5 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  37.16 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  41.23 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0336  thiamine-monophosphate kinase  38.31 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  37.61 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  38.74 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  38.71 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0358  thiamine-monophosphate kinase  36.98 
 
 		 355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00127511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  43.46 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  36.57 
 
 		 355 aa  172  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  34.5 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  36.42 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2071  thiamine-monophosphate kinase  41.21 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  36.99 
 
 		 346 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0528  thiamine-monophosphate kinase  35.43 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1213  thiamine-monophosphate kinase  36.18 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00911735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  41.18 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  38.84 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0332  thiamine-monophosphate kinase  35.28 
 
 		 354 aa  170  4e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  38.84 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  36.93 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  33.95 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  36.36 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  38.22 
 
 		 334 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  37.09 
 
 		 348 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  37.35 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  37.94 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2915  thiamine-monophosphate kinase  36.81 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0468053  hitchhiker  0.00439314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3537  thiamine-monophosphate kinase  37.85 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.719113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2612  thiamine-monophosphate kinase  35.13 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1047  thiamine-monophosphate kinase  38.48 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  36.75 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0928  thiamine-monophosphate kinase  38.48 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.01 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  36.81 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  35.67 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0376  thiamine-monophosphate kinase  35.57 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000100776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  38.28 
 
 		 324 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  38.05 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  35.06 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  39.51 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  39.82 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  35.05 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0714  thiamine-monophosphate kinase  38.61 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>