More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0100 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  51.04 
 
 
204 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  47.72 
 
 
207 aa  207  6e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  46.7 
 
 
207 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  44.95 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  48.94 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  47.4 
 
 
204 aa  194  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45.65 
 
 
194 aa  191  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  46.49 
 
 
202 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  48.66 
 
 
201 aa  187  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  45.69 
 
 
203 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  46.03 
 
 
202 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  46.46 
 
 
203 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  45.5 
 
 
202 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  42.36 
 
 
219 aa  182  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  43.35 
 
 
219 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2348  guanylate kinase  43.35 
 
 
219 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  44.27 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  40.61 
 
 
200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  44.22 
 
 
209 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  43.09 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  40.2 
 
 
212 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  43.48 
 
 
210 aa  177  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  45.16 
 
 
205 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2473  guanylate kinase  45.65 
 
 
216 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  43.48 
 
 
206 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  46.2 
 
 
216 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  45.21 
 
 
220 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  43.62 
 
 
203 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  41.8 
 
 
223 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  44.68 
 
 
219 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  43.62 
 
 
203 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  41.8 
 
 
223 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  43.98 
 
 
220 aa  174  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  174  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  41.62 
 
 
195 aa  174  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  43.89 
 
 
212 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  42.39 
 
 
202 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  43.85 
 
 
206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0520  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0959  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.426596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0999  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  42.02 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  40.5 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  44.02 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  46.2 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  48.84 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  45.65 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  41.67 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0669  guanylate kinase  44.5 
 
 
228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.877591  normal  0.744923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  41.8 
 
 
223 aa  171  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45.56 
 
 
194 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  41.18 
 
 
211 aa  171  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  41.53 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  40.32 
 
 
216 aa  171  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  45.11 
 
 
221 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  46.81 
 
 
202 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  170  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  41.94 
 
 
207 aa  170  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  44.57 
 
 
206 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  42.63 
 
 
199 aa  170  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  43.62 
 
 
220 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.11 
 
 
207 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  42.19 
 
 
207 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  47.62 
 
 
207 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  43.48 
 
 
205 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  40.64 
 
 
215 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  47.62 
 
 
207 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  42.55 
 
 
204 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  40.43 
 
 
219 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  42.55 
 
 
216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  42.55 
 
 
216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  43.32 
 
 
202 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  45.11 
 
 
221 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  44.57 
 
 
210 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  44.57 
 
 
210 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  44.57 
 
 
210 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  39.89 
 
 
220 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  44.57 
 
 
210 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  45.11 
 
 
207 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0905  guanylate kinase  44.68 
 
 
225 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  43.98 
 
 
208 aa  168  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  168  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  44.57 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.68 
 
 
211 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.57 
 
 
224 aa  167  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  41.03 
 
 
231 aa  167  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  39.89 
 
 
210 aa  167  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  39.34 
 
 
209 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>