221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2010 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2010  D-cysteine desulfhydrase  100 
 
 		 334 aa  655    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152874  decreased coverage  0.00891545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  68.29 
 
 		 334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  67.17 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  66.97 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  67.48 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  67.17 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  67.17 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  67.17 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  67.48 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  67.48 
 
 		 339 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  66.67 
 
 		 332 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  66.87 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  61.96 
 
 		 330 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  59.44 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  59.44 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  59.44 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  61.35 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  59.44 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  59.13 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  58.39 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  58.39 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  58.07 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  58.39 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  58.39 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  58.39 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  58.07 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  60.56 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  46.63 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  47.4 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  44.51 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  43.12 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  42.81 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  43.12 
 
 		 331 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  42.81 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  42.51 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  42.81 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  42.38 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  42.51 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  44.65 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  42.07 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  44.65 
 
 		 337 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  45.06 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  42.2 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  41.09 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  41.19 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  41.09 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  46.18 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  42.17 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  41.02 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  43.5 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.1 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  42.68 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  43.03 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  43.67 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2314  D-cysteine desulfhydrase  43.03 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0934  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  40.85 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  42.86 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  43.79 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4819  D-cysteine desulfhydrase  42.41 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2876  D-cysteine desulfhydrase  40.12 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0310  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.36 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.72 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.75 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  40.18 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.07 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5055  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  43.12 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0798685  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.76 
 
 		 337 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  38.44 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  38.44 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.67 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  38.86 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.04 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  40.56 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  40.72 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1521  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.97 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.76 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  39.09 
 
 		 359 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.76 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.34 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  39.34 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  40.41 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6456  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  36.75 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.379637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.39 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  38.82 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.76 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.92 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.6 
 
 		 338 aa  189  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.25 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.86 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.07 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  normal  0.0222405 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  38.25 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.54 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4127  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  35.21 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5685  D-cysteine desulfhydrase  42.99 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104334 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.95 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.95 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.95 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  37.95 
 
 		 338 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>