257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4127 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4127  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  100 
 
 
339 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6456  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  86.73 
 
 
339 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.379637 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5856  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  78.27 
 
 
337 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0688511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  77.38 
 
 
337 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1521  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  77.38 
 
 
336 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  76.19 
 
 
337 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  69.53 
 
 
338 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.34 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  69.53 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  69.53 
 
 
338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0952  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5215  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.34 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.93 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.34 
 
 
338 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.34 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1385  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0995718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.46 
 
 
338 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.05 
 
 
338 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  68.05 
 
 
338 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2004  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.86 
 
 
338 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.876567  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.86 
 
 
338 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.86 
 
 
338 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.75 
 
 
338 aa  481  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  67.16 
 
 
338 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_003296  RS05576  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.57 
 
 
338 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.57 
 
 
338 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  65.98 
 
 
338 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.86 
 
 
342 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3675  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.27 
 
 
338 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5099  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  66.57 
 
 
338 aa  472  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  65.09 
 
 
338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  65.68 
 
 
338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3877  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  65.68 
 
 
356 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81785 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  60.53 
 
 
335 aa  435  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  59.7 
 
 
335 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  normal  0.0222405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1412  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  59.82 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322961  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00190  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  54.17 
 
 
345 aa  372  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000288406  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08899  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01030)  54.79 
 
 
336 aa  311  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  41.82 
 
 
347 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  41.64 
 
 
333 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  39.7 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  39.82 
 
 
331 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  39.4 
 
 
334 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  39.76 
 
 
332 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  39.39 
 
 
331 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  39.39 
 
 
331 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  39.21 
 
 
331 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  39.39 
 
 
331 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  39.09 
 
 
331 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  38.48 
 
 
331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  39.09 
 
 
331 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  38.79 
 
 
331 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  38.48 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3180  D-cysteine desulfhydrase  38.55 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.526016  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0339  D-cysteine desulfhydrase  37.03 
 
 
333 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0969391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2137  D-cysteine desulfhydrase  39 
 
 
339 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3006  D-cysteine desulfhydrase  39.3 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3094  D-cysteine desulfhydrase  39.3 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3059  D-cysteine desulfhydrase  39.3 
 
 
339 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0774  D-cysteine desulfhydrase  39 
 
 
339 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1802  D-cysteine desulfhydrase  36.39 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2006  D-cysteine desulfhydrase  38.71 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2607  D-cysteine desulfhydrase  38.71 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1404  D-cysteine desulfhydrase  35.8 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1301  D-cysteine desulfhydrase  36.5 
 
 
336 aa  209  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166023  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  36.94 
 
 
365 aa  205  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1185  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  39.53 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0389534  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1604  D-cysteine desulfhydrase  35.82 
 
 
340 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.033923  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2153  D-cysteine desulfhydrase  36.2 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0177604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  37.58 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  37.16 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1828  D-cysteine desulfhydrase  36.31 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  37.58 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  36.67 
 
 
328 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  37.58 
 
 
339 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1047  D-cysteine desulfhydrase  36.36 
 
 
328 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  37.43 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1727  pyridoxal phosphate-dependent enzymes, D-cysteine desulfhydrase family  36.36 
 
 
328 aa  195  9e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00524906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1263  D-cysteine desulfhydrase  36.36 
 
 
328 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0547515  normal  0.0193238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1720  D-cysteine desulfhydrase  36.36 
 
 
328 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.628209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2018  D-cysteine desulfhydrase  36.36 
 
 
328 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0820004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  35.31 
 
 
330 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1784  D-cysteine desulfhydrase  35.8 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  35.84 
 
 
330 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5179  pyridoxal phosphate-dependent deaminase, putative  34.43 
 
 
332 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  35.35 
 
 
332 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  37.17 
 
 
345 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2506  D-cysteine desulfhydrase  36.78 
 
 
361 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  0.820205 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  35.8 
 
 
359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  35.52 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  35.52 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  35.52 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  35.52 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  34.72 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  35.52 
 
 
328 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>